{"id":5538,"date":"2026-09-12T00:03:03","date_gmt":"2026-09-11T15:03:03","guid":{"rendered":"https:\/\/blog.id774.net\/entry\/?p=5538"},"modified":"2026-09-11T09:36:32","modified_gmt":"2026-09-11T00:36:32","slug":"scls-%e3%81%af%e6%93%ac%e4%bc%bc%e6%99%82%e9%96%93%e3%81%ae%e9%80%94%e4%b8%ad%e3%81%a7%e5%a4%89%e3%82%8f%e3%82%8b%e9%81%ba%e4%bc%9d%e5%ad%90%e3%82%92%e3%81%a9%e3%81%86%e6%8b%be%e3%81%86%e3%81%ae","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blog.id774.net\/entry\/2026\/09\/12\/5538\/","title":{"rendered":"scLS \u306f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u9014\u4e2d\u3067\u5909\u308f\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u3069\u3046\u62fe\u3046\u306e\u304b"},"content":{"rendered":"

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\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3<\/th>\n\u521d\u671f<\/th>\n\u4e2d\u671f<\/th>\n\u5f8c\u671f<\/th>\n\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u3060\u3051\u3092\u6bd4\u8f03\u3057\u305f\u5834\u5408<\/th>\n\u904e\u7a0b\u5168\u4f53\u3067\u89b3\u5bdf\u3067\u304d\u308b\u3053\u3068<\/th>\n<\/tr>\n<\/thead>\n
\u907a\u4f1d\u5b50 A<\/td>\n\u4f4e\u3044<\/td>\n\u4e2d\u7a0b\u5ea6<\/td>\n\u9ad8\u3044<\/td>\n\u521d\u671f\u3068\u5f8c\u671f\u306e\u5dee\u304c\u5927\u304d\u304f\u3001\u5909\u5316\u3092\u691c\u51fa\u3057\u3084\u3059\u3044\u3002<\/td>\n\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u6301\u7d9a\u7684\u306b\u4e0a\u6607\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u907a\u4f1d\u5b50 B<\/td>\n\u4f4e\u3044<\/td>\n\u9ad8\u3044<\/td>\n\u4f4e\u3044<\/td>\n\u521d\u671f\u3068\u5f8c\u671f\u306e\u5dee\u304c\u5c0f\u3055\u304f\u3001\u5909\u5316\u304c\u5f31\u304f\u898b\u3048\u308b\u3002<\/td>\n\u4e2d\u671f\u306b\u4e00\u904e\u6027\u306e\u5927\u304d\u306a\u767a\u73fe\u30d4\u30fc\u30af\u304c\u5b58\u5728\u3059\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

\u907a\u4f1d\u5b50 A \u306f\u3001\u521d\u671f\u304b\u3089\u4e2d\u671f\u3001\u5f8c\u671f\u3078\u9032\u3080\u306b\u3064\u308c\u3066\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u5897\u3048\u3066\u3044\u308b\u3002\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u4e8c\u70b9\u3060\u3051\u3067\u3082\u4f4e\u3044\u72b6\u614b\u304b\u3089\u9ad8\u3044\u72b6\u614b\u3078\u306e\u79fb\u884c\u304c\u6b8b\u308b\u305f\u3081\u3001\u7d42\u70b9\u5dee\u3092\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u65b9\u6cd5\u3067\u3082\u5909\u5316\u3092\u62fe\u3044\u3084\u3059\u3044\u3002\u907a\u4f1d\u5b50 B \u306f\u4e8b\u60c5\u304c\u7570\u306a\u308b\u3002\u4e2d\u671f\u306b\u306f\u907a\u4f1d\u5b50 A \u3088\u308a\u5927\u304d\u306a\u5909\u5316\u3092\u793a\u3057\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001\u5f8c\u671f\u306b\u306f\u521d\u671f\u306e\u6c34\u6e96\u3078\u623b\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u7d42\u76e4\u306e\u7d30\u80de\u3060\u3051\u3092\u53d6\u308a\u51fa\u305b\u3070\u3001\u9014\u4e2d\u3067\u8d77\u304d\u305f\u767a\u73fe\u4e0a\u6607\u306b\u95a2\u3059\u308b\u60c5\u5831\u306f\u5931\u308f\u308c\u308b\u3002<\/p>\n

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\u3055\u3089\u306b\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u89e3\u6790\u3067\u306f\u691c\u5b9a\u306b\u5165\u529b\u3059\u308b\u6a2a\u8ef8\u305d\u306e\u3082\u306e\u306b\u3082\u4e0d\u78ba\u5b9f\u6027\u304c\u3042\u308b\u3002\u5b9f\u9a13\u3067\u300c\u57f9\u990a\u958b\u59cb\u304b\u3089 6 \u6642\u9593\u5f8c\u300d\u3068\u8a18\u9332\u3055\u308c\u305f\u6642\u9593\u306a\u3089\u3001\u305d\u306e\u5024\u306f\u89b3\u6e2c\u6761\u4ef6\u3068\u3057\u3066\u4e0e\u3048\u3089\u308c\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306f\u305d\u3046\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u7d30\u80de\u306e\u8ecc\u8de1\u3068\u9806\u5e8f\u3092\u63a8\u5b9a\u3057\u3001\u305d\u306e\u7d50\u679c\u3092\u6642\u9593\u8ef8\u3068\u3057\u3066\u4e0b\u6d41\u89e3\u6790\u3078\u6e21\u3059\u3002\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u3067\u7d30\u80de\u306e\u9806\u5e8f\u304c\u5909\u308f\u308c\u3070\u3001\u540c\u3058\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u63cf\u304b\u308c\u308b\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3082\u5909\u308f\u308a\u3001\u305d\u306e\u66f2\u7dda\u306b\u57fa\u3065\u304f\u691c\u5b9a\u7d50\u679c\u307e\u3067\u5909\u5316\u3057\u5f97\u308b\u3002<\/p>\n

Song \u3068 Li \u304c\u63d0\u6848\u3057\u305f PseudotimeDE \u306f\u3001\u3053\u306e\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u6642\u9593\u8ef8\u3092\u56fa\u5b9a\u5024\u3068\u3057\u3066\u7121\u6761\u4ef6\u306b\u6271\u3046\u3053\u3068\u306b\u3088\u3063\u3066\u751f\u3058\u308b\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u554f\u984c\u3092\u6b63\u9762\u304b\u3089\u6271\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u518d\u63a8\u5b9a\u3059\u308b\u904e\u7a0b\u3092\u542b\u3081\u3066\u5e30\u7121\u5206\u5e03\u3092\u69cb\u6210\u3057\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u3068\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u95a2\u9023\u306b\u3064\u3044\u3066 P \u5024\u3092\u9069\u5207\u306b\u8f03\u6b63\u3059\u308b\u3053\u3068\u3092\u91cd\u8996\u3057\u305f\u65b9\u6cd5\u3067\u3042\u308b[5]<\/a>\u3002\u3053\u308c\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u89e3\u6790\u3067\u306f\u300c\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u3069\u306e\u5f62\u3067\u8868\u73fe\u3059\u308b\u304b\u300d\u3068\u300c\u305d\u306e\u6a2a\u8ef8\u3092\u3069\u3053\u307e\u3067\u78ba\u304b\u306a\u3082\u306e\u3068\u3057\u3066\u6271\u3046\u304b\u300d\u304c\u5225\u3005\u306e\u8ad6\u70b9\u306b\u306a\u308b\u3053\u3068\u3092\u793a\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002<\/p>\n

\u4e0b\u6d41\u89e3\u6790\u306b\u306f\u3001\u5c11\u306a\u304f\u3068\u3082\u4e8c\u3064\u306e\u63a8\u5b9a\u304c\u9023\u7d9a\u3057\u3066\u5165\u308b\u3002\u307e\u305a\u591a\u6570\u306e\u7d30\u80de\u304b\u3089\u8ecc\u8de1\u3068\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u63a8\u5b9a\u3057\u3001\u305d\u306e\u5f8c\u3067\u3001\u305d\u306e\u63a8\u5b9a\u8ef8\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u5404\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u5909\u5316\u3092\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u3002\u524d\u6bb5\u306e\u9806\u5e8f\u63a8\u5b9a\u304c\u305a\u308c\u308c\u3070\u5f8c\u6bb5\u306e\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3082\u5909\u308f\u308a\u3001\u5f8c\u6bb5\u3067\u63a1\u7528\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u304c\u9055\u3048\u3070\u540c\u3058\u66f2\u7dda\u304b\u3089\u9078\u3070\u308c\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3082\u5909\u308f\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u4e00\u5ea6\u4f5c\u308c\u3070\u5ba2\u89b3\u7684\u306a\u6642\u7cfb\u5217\u304c\u5b8c\u6210\u3059\u308b\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u3068\u767a\u73fe\u5dee\u691c\u5b9a\u306e\u4e21\u65b9\u3092\u542b\u3081\u3066\u521d\u3081\u3066\u300c\u5909\u5316\u3057\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u3068\u3044\u3046\u7d50\u679c\u304c\u6210\u7acb\u3059\u308b\u3002<\/p>\n

\u6b21\u7ae0\u3067\u6271\u3046\u65b9\u6cd5\u304c\u5909\u66f4\u3059\u308b\u306e\u306f\u3001\u3053\u306e\u3046\u3061\u5f8c\u6bb5\u3067\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u3069\u306e\u3088\u3046\u306b\u8868\u73fe\u3057\u3066\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u304b\u3068\u3044\u3046\u90e8\u5206\u3067\u3042\u308b\u3002\u65e2\u5b58\u306e\u56de\u5e30\u30e2\u30c7\u30eb\u3078\u3055\u3089\u306b\u5225\u306e\u66f2\u7dda\u5f62\u72b6\u3092\u8ffd\u52a0\u3059\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u5024\u3092\u5225\u306e\u8868\u73fe\u3078\u5909\u63db\u3059\u308b\u3002\u6b21\u306b\u898b\u308b\u3079\u304d\u306a\u306e\u306f\u3001\u3053\u306e\u8868\u73fe\u5909\u63db\u306b\u3088\u3063\u3066\u3001\u6642\u9593\u9818\u57df\u306e\u66f2\u7dda\u3092\u76f4\u63a5\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u5834\u5408\u3068\u306f\u4f55\u304c\u5909\u308f\u308b\u306e\u304b\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\n

3. scLS \u306f\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u5468\u6ce2\u6570\u9818\u57df\u3078\u79fb\u3057\u3066\u8abf\u3079\u308b<\/h2>\n

Iuchi \u3068 Hamada \u304c\u63d0\u6848\u3057\u305f scLS \u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u3092 Lomb\u2013Scargle periodogram \u3078\u5909\u63db\u3057\u3001\u305d\u306e\u7d50\u679c\u3092\u4f7f\u3063\u3066\u4e8c\u7a2e\u985e\u306e\u691c\u5b9a\u3092\u884c\u3046[6]<\/a>\u3002\u7b2c\u4e00\u306e dynamic expression test \u306f\u3001\u4e00\u3064\u306e\u8ecc\u8de1\u306e\u4e2d\u3067\u3001\u3042\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u767a\u73fe\u304c\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3068\u7121\u95a2\u4fc2\u306b\u3070\u3089\u3064\u3044\u3066\u3044\u308b\u306e\u304b\u3001\u305d\u308c\u3068\u3082\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u69cb\u9020\u7684\u306a\u5909\u5316\u3092\u6301\u3064\u306e\u304b\u3092\u8abf\u3079\u308b\u3002\u7b2c\u4e8c\u306e shifted expression test \u306f\u3001\u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u306e\u3088\u3046\u306a\u4e8c\u6761\u4ef6\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u5358\u7d14\u306b\u9ad8\u3044\u304b\u4f4e\u3044\u304b\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u5168\u4f53\u304c\u7570\u306a\u308b\u304b\u3092\u8abf\u3079\u308b\u3002\u524d\u8005\u304c\u300c\u3053\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u306f\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306e\u9014\u4e2d\u3067\u5909\u5316\u3059\u308b\u304b\u300d\u3092\u554f\u3044\u3001\u5f8c\u8005\u304c\u300c\u6761\u4ef6\u3092\u5909\u3048\u308b\u3068\u3001\u305d\u306e\u5909\u308f\u308a\u65b9\u307e\u3067\u5909\u5316\u3059\u308b\u304b\u300d\u3092\u554f\u3046\u69cb\u6210\u306b\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u65b9\u6cd5\u3092\u7406\u89e3\u3059\u308b\u306b\u306f\u3001\u307e\u305a\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u304c\u901a\u5e38\u306e\u6642\u7cfb\u5217\u3068\u9055\u3046\u3053\u3068\u3092\u62bc\u3055\u3048\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002\u5b9f\u9a13\u3067 0 \u5206\u300110 \u5206\u300120 \u5206\u300130 \u5206\u3068\u6e2c\u5b9a\u3059\u308c\u3070\u3001\u96a3\u308a\u5408\u3046\u89b3\u6e2c\u70b9\u306e\u6642\u9593\u9593\u9694\u306f\u4e00\u5b9a\u3067\u3042\u308b\u3002\u4e00\u65b9\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306f\u7d30\u80de\u96c6\u56e3\u304b\u3089\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u9032\u884c\u8ef8\u306a\u306e\u3067\u3001\u7d30\u80de\u304c 0.0\u30010.1\u30010.2\u30010.3 \u306e\u3088\u3046\u306b\u7b49\u9593\u9694\u3067\u914d\u7f6e\u3055\u308c\u308b\u3068\u306f\u9650\u3089\u306a\u3044\u3002\u72b6\u614b\u306e\u3088\u304f\u89b3\u6e2c\u3055\u308c\u305f\u9818\u57df\u306b\u306f\u591a\u304f\u306e\u7d30\u80de\u304c\u96c6\u307e\u308a\u3001\u9077\u79fb\u304c\u901f\u3044\u9818\u57df\u3084\u53d6\u5f97\u3057\u306b\u304f\u3044\u72b6\u614b\u3067\u306f\u7d30\u80de\u304c\u758e\u306b\u306a\u308b\u3053\u3068\u3082\u3042\u308b\u3002\u305d\u306e\u7d50\u679c\u3001\u5404\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u5f97\u3089\u308c\u308b\u306e\u306f\u3001\u4e0d\u7b49\u9593\u9694\u306a\u4f4d\u7f6e\u306b\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u4e26\u3093\u3060\u7cfb\u5217\u306b\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

Lomb\u2013Scargle periodogram \u306f\u3001\u3053\u306e\u3088\u3046\u306a\u4e0d\u7b49\u9593\u9694\u306e\u89b3\u6e2c\u5024\u304b\u3089\u5468\u6ce2\u6570\u6210\u5206\u3092\u8abf\u3079\u308b\u305f\u3081\u306b\u767a\u5c55\u3057\u3066\u304d\u305f\u3002Scargle \u306f 1982 \u5e74\u3001\u4e0d\u7b49\u9593\u9694\u306b\u89b3\u6e2c\u3055\u308c\u305f\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u3064\u3044\u3066\u30b9\u30da\u30af\u30c8\u30eb\u89e3\u6790\u3092\u884c\u3046\u969b\u306e\u7d71\u8a08\u7684\u6027\u8cea\u3092\u6574\u7406\u3057\u305f[7]<\/a>\u3002\u901a\u5e38\u306e\u96e2\u6563\u30d5\u30fc\u30ea\u30a8\u5909\u63db\u3067\u306f\u3001\u89b3\u6e2c\u70b9\u304c\u7b49\u9593\u9694\u306b\u4e26\u3076\u3053\u3068\u3092\u524d\u63d0\u306b\u6271\u3046\u306e\u304c\u81ea\u7136\u3060\u304c\u3001Lomb\u2013Scargle \u6cd5\u306f\u89b3\u6e2c\u6642\u70b9\u304c\u4e0d\u898f\u5247\u3067\u3082\u3001\u305d\u306e\u4f4d\u7f6e\u60c5\u5831\u3092\u4fdd\u3063\u305f\u307e\u307e\u5404\u5468\u6ce2\u6570\u306b\u5bfe\u5fdc\u3059\u308b\u5909\u52d5\u306e\u5f37\u3055\u3092\u8a55\u4fa1\u3067\u304d\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u7d30\u80de\u914d\u7f6e\u304c\u4e0d\u7b49\u9593\u9694\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u306f\u3001\u3053\u306e\u65b9\u6cd5\u3092\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u89e3\u6790\u3078\u6301\u3061\u8fbc\u3080\u6280\u8853\u7684\u306a\u7406\u7531\u306e\u4e00\u3064\u306b\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

\u305f\u3060\u3057\u3001\u672c\u7a3f\u3067\u3044\u3046\u300c\u5468\u6ce2\u6570\u300d\u3092\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u304c 12 \u6642\u9593\u5468\u671f\u3084 24 \u6642\u9593\u5468\u671f\u3067\u767a\u73fe\u3057\u3066\u3044\u308b\u304b\u3092\u6e2c\u308b\u91cf\u3068\u3057\u3066\u8aad\u3080\u3068\u3001scLS \u306e\u72d9\u3044\u3092\u53d6\u308a\u9055\u3048\u308b\u3002\u539f\u8ad6\u6587\u3067\u306f\u3001Lomb\u2013Scargle periodogram \u3092\u751f\u7269\u5b66\u7684\u306a\u5468\u671f\u305d\u306e\u3082\u306e\u306e\u63a8\u5b9a\u5668\u3068\u3057\u3066\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u5225\u306e\u8868\u73fe\u3078\u5199\u3059\u305f\u3081\u306b\u4f7f\u3063\u3066\u3044\u308b[6]<\/a>\u3002\u5143\u306e\u66f2\u7dda\u3067\u306f\u3001\u6a2a\u8ef8\u304c\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3001\u7e26\u8ef8\u304c\u767a\u73fe\u91cf\u3067\u3042\u308a\u3001\u300c\u3069\u306e\u4f4d\u7f6e\u3067\u3069\u308c\u3060\u3051\u767a\u73fe\u3057\u305f\u304b\u300d\u3092\u76f4\u63a5\u8aad\u3080\u3002\u30d4\u30ea\u30aa\u30c9\u30b0\u30e9\u30e0\u3078\u5909\u63db\u3059\u308b\u3068\u3001\u305d\u306e\u66f2\u7dda\u306b\u542b\u307e\u308c\u308b\u3086\u3063\u304f\u308a\u3057\u305f\u5909\u5316\u3084\u3001\u3088\u308a\u7d30\u304b\u306a\u4e0a\u4e0b\u52d5\u304c\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u7570\u306a\u308b\u5468\u6ce2\u6570\u6210\u5206\u306e\u5f37\u3055\u3068\u3057\u3066\u8868\u73fe\u3055\u308c\u308b\u3002<\/p>\n\n\n\n\n\n\n
\u8868\u73fe<\/th>\n\u4e3b\u306b\u4fdd\u6301\u3059\u308b\u60c5\u5831<\/th>\n\u8aad\u307f\u53d6\u308a\u65b9<\/th>\n<\/tr>\n<\/thead>\n
\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u767a\u73fe\u66f2\u7dda<\/td>\n\u3069\u306e\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3067\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u9ad8\u3044\u304b\u3001\u4f4e\u3044\u304b\u3068\u3044\u3046\u4f4d\u7f6e\u3068\u5024\u306e\u95a2\u4fc2\u3092\u76f4\u63a5\u8868\u3059\u3002<\/td>\n\u4e2d\u76e4\u3067\u4e0a\u304c\u308b\u3001\u5f8c\u534a\u3067\u4e0b\u304c\u308b\u3068\u3044\u3063\u305f\u5909\u5316\u3092\u66f2\u7dda\u306e\u5f62\u3068\u3057\u3066\u8aad\u3080\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
Lomb\u2013Scargle periodogram<\/td>\n\u305d\u306e\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u306b\u3001\u3069\u306e\u7a0b\u5ea6\u306e\u6642\u9593\u30b9\u30b1\u30fc\u30eb\u306e\u5909\u52d5\u304c\u542b\u307e\u308c\u308b\u304b\u3092\u5468\u6ce2\u6570\u3054\u3068\u306e\u5f37\u3055\u3068\u3057\u3066\u8868\u3059\u3002<\/td>\n\u5143\u306e\u66f2\u7dda\u5f62\u72b6\u3092\u5225\u306e\u7279\u5fb4\u7a7a\u9593\u3078\u5909\u63db\u3057\u3001\u5909\u5316\u306e\u6709\u7121\u3084\u6761\u4ef6\u9593\u306e\u9055\u3044\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

\u305f\u3068\u3048\u3070\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u521d\u671f\u304b\u3089\u7d42\u76e4\u307e\u3067\u3086\u3063\u304f\u308a\u5897\u3048\u7d9a\u3051\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3068\u3001\u4e2d\u76e4\u3060\u3051\u6025\u306b\u4e0a\u304c\u3063\u3066\u518d\u3073\u4e0b\u304c\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3067\u306f\u3001\u5143\u306e\u6642\u9593\u9818\u57df\u3067\u3082\u66f2\u7dda\u5f62\u72b6\u304c\u7570\u306a\u308b\u3002scLS \u306f\u3001\u3053\u306e\u9055\u3044\u3092\u300c\u76f4\u7dda\u300d\u300c\u4e00\u3064\u5c71\u306e\u66f2\u7dda\u300d\u3068\u3044\u3063\u305f\u7279\u5b9a\u306e\u95a2\u6570\u5f62\u3078\u5206\u985e\u3057\u3066\u304b\u3089\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u3092\u30d4\u30ea\u30aa\u30c9\u30b0\u30e9\u30e0\u3078\u5909\u63db\u3059\u308b\u3002\u3053\u308c\u306b\u3088\u308a\u3001\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u3042\u3089\u304b\u3058\u3081\u4e00\u7a2e\u985e\u306e\u5f62\u3078\u56fa\u5b9a\u3057\u306a\u304f\u3066\u3082\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u4f9d\u5b58\u3057\u305f\u69cb\u9020\u7684\u306a\u5909\u5316\u3092\u691c\u51fa\u5bfe\u8c61\u306b\u3067\u304d\u308b\u3002<\/p>\n

dynamic expression test \u304c\u5229\u7528\u3059\u308b\u306e\u306f\u3001\u3053\u306e\u6027\u8cea\u3067\u3042\u308b\u3002\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3068\u7121\u95a2\u4fc2\u306b\u4e0d\u898f\u5247\u306b\u4e26\u3093\u3067\u3044\u308b\u306a\u3089\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306b\u4e00\u8cab\u3057\u305f\u5909\u52d5\u69cb\u9020\u306f\u751f\u3058\u306b\u304f\u3044\u3002\u4e00\u65b9\u3001\u521d\u671f\u304b\u3089\u5f8c\u671f\u3078\u5897\u3048\u308b\u3001\u4e2d\u76e4\u306b\u30d4\u30fc\u30af\u3092\u4f5c\u308b\u3001\u3044\u3063\u305f\u3093\u4f4e\u4e0b\u3057\u3066\u518d\u3073\u4e0a\u6607\u3059\u308b\u3068\u3044\u3063\u305f\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u306b\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u4f4d\u7f6e\u3068\u5bfe\u5fdc\u3057\u305f\u69cb\u9020\u304c\u3042\u308b\u3002scLS \u306f\u305d\u306e\u69cb\u9020\u3092\u30d4\u30ea\u30aa\u30c9\u30b0\u30e9\u30e0\u4e0a\u3067\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u305f\u3081\u3001\u691c\u51fa\u5bfe\u8c61\u3092\u300c\u5358\u8abf\u5897\u52a0\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u3084\u300c\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u304c\u9055\u3046\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u306b\u9650\u5b9a\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u306a\u3044[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u9055\u3044\u306f\u3001\u7b2c 1 \u7ae0\u3067\u793a\u3057\u305f\u907a\u4f1d\u5b50 A \u3068\u907a\u4f1d\u5b50 B \u306b\u305d\u306e\u307e\u307e\u5bfe\u5fdc\u3059\u308b\u3002\u907a\u4f1d\u5b50 A \u306e\u300c\u4f4e\u3044 \u2192 \u4e2d\u7a0b\u5ea6 \u2192 \u9ad8\u3044\u300d\u3068\u3044\u3046\u6301\u7d9a\u7684\u306a\u4e0a\u6607\u3082\u3001\u907a\u4f1d\u5b50 B \u306e\u300c\u4f4e\u3044 \u2192 \u9ad8\u3044 \u2192 \u4f4e\u3044\u300d\u3068\u3044\u3046\u4e00\u904e\u6027\u306e\u30d4\u30fc\u30af\u3082\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u69cb\u9020\u7684\u5909\u5316\u3067\u3042\u308b\u3002\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u5dee\u3060\u3051\u306a\u3089\u4e21\u8005\u3078\u306e\u611f\u5ea6\u306f\u5927\u304d\u304f\u7570\u306a\u308b\u304c\u3001scLS \u306e dynamic expression test \u3067\u306f\u3001\u3069\u3061\u3089\u3082\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u4f9d\u5b58\u3057\u305f\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3068\u3057\u3066\u691c\u5b9a\u5bfe\u8c61\u306b\u5165\u308b\u3002\u3053\u3053\u3067\u5f97\u3089\u308c\u308b\u5229\u70b9\u306f\u3001\u8907\u96d1\u306a\u66f2\u7dda\u3092\u3069\u308c\u3082\u540c\u3058\u3082\u306e\u3068\u3057\u3066\u6271\u3046\u3053\u3068\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u7d42\u70b9\u5dee\u3068\u3044\u3046\u4e00\u3064\u306e\u7279\u5fb4\u3060\u3051\u306b\u60c5\u5831\u3092\u7e2e\u7d04\u3057\u306a\u3044\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

shifted expression test \u3067\u306f\u3001\u540c\u3058\u8868\u73fe\u5909\u63db\u3092\u4e8c\u6761\u4ef6\u306e\u6bd4\u8f03\u306b\u4f7f\u3046\u3002\u305f\u3068\u3048\u3070\u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u3042\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u304c\u3069\u3061\u3089\u3067\u3082\u6700\u7d42\u7684\u306b\u306f\u540c\u3058\u767a\u73fe\u91cf\u3078\u5230\u9054\u3057\u305f\u3068\u3057\u3066\u3082\u3001\u91ce\u751f\u578b\u3067\u306f\u65e9\u3044\u6bb5\u968e\u306b\u30d4\u30fc\u30af\u304c\u3042\u308a\u3001\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3067\u306f\u5f8c\u534a\u307e\u3067\u4e0a\u6607\u3057\u306a\u3044\u3068\u3044\u3046\u9055\u3044\u304c\u3042\u308a\u5f97\u308b\u3002\u7279\u5b9a\u6642\u70b9\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u3060\u3051\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308c\u3070\u3001\u9078\u3093\u3060\u6642\u70b9\u306b\u3088\u3063\u3066\u5dee\u304c\u5927\u304d\u304f\u898b\u3048\u305f\u308a\u6d88\u3048\u305f\u308a\u3059\u308b\u3002scLS \u306f\u4e21\u6761\u4ef6\u306e\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u305d\u308c\u305e\u308c\u30d1\u30ef\u30fc\u30b9\u30da\u30af\u30c8\u30eb\u3078\u5909\u63db\u3057\u3001\u305d\u306e\u9055\u3044\u3092\u4f7f\u3063\u3066\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u300c\u5909\u308f\u308a\u65b9\u305d\u306e\u3082\u306e\u300d\u304c\u6761\u4ef6\u9593\u3067\u305a\u308c\u3066\u3044\u308b\u304b\u3092\u8a55\u4fa1\u3059\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

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scLS \u306e\u8a2d\u8a08\u3092\u6574\u7406\u3059\u308b\u3068\u3001\u5909\u66f4\u70b9\u306f\u300c\u3088\u308a\u8907\u96d1\u306a\u56de\u5e30\u5f0f\u3092\u7528\u610f\u3057\u305f\u3053\u3068\u300d\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u691c\u5b9a\u3078\u6e21\u3059\u8868\u73fe\u3092\u5909\u3048\u305f\u3053\u3068\u306b\u3042\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u3092\u76f4\u63a5\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u4ee3\u308f\u308a\u306b\u3001\u4e0d\u7b49\u9593\u9694\u306a\u4f4d\u7f6e\u60c5\u5831\u3092\u4fdd\u3063\u305f\u307e\u307e Lomb\u2013Scargle periodogram \u3078\u5909\u63db\u3057\u3001\u305d\u306e\u5468\u6ce2\u6570\u8868\u73fe\u304b\u3089\u52d5\u7684\u767a\u73fe\u3068\u6761\u4ef6\u9593\u5dee\u3092\u8abf\u3079\u308b\u3002\u3053\u306e\u8868\u73fe\u5909\u63db\u306b\u5b9f\u969b\u306e\u5229\u70b9\u304c\u3042\u308b\u304b\u306f\u3001\u6570\u7406\u7684\u306a\u67d4\u8edf\u6027\u3060\u3051\u3067\u306f\u5224\u65ad\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002\u6b21\u306b\u78ba\u8a8d\u3059\u3079\u304d\u306a\u306e\u306f\u3001\u5b9f\u969b\u306e\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u3001\u65e2\u5b58\u306e\u691c\u5b9a\u3068\u306f\u7570\u306a\u308b\u3069\u306e\u3088\u3046\u306a\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u304c\u691c\u51fa\u3055\u308c\u305f\u304b\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

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4. \u9014\u4e2d\u3067\u4e0a\u304c\u3063\u3066\u5143\u306b\u623b\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u3001\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u9055\u3063\u3066\u62fe\u3063\u305f<\/h2>\n

scLS \u306e\u7279\u5fb4\u304c\u6700\u3082\u5177\u4f53\u7684\u306b\u898b\u3048\u308b\u306e\u304c\u3001\u30b7\u30e7\u30a6\u30b8\u30e7\u30a6\u30d0\u30a8\u7cbe\u5de3\u306e\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u4f7f\u3063\u305f\u89e3\u6790\u3067\u3042\u308b\u3002\u5143\u30c7\u30fc\u30bf\u306f Raz \u3089\u304c\u6210\u4f53\u30b7\u30e7\u30a6\u30b8\u30e7\u30a6\u30d0\u30a8\u7cbe\u5de3\u3092\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u3068\u5358\u4e00\u6838 RNA-seq \u3067\u89e3\u6790\u3057\u305f\u3082\u306e\u3067\u3001\u751f\u6b96\u7cfb\u5217\u3068\u4f53\u7d30\u80de\u7cfb\u5217\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u767a\u751f\u6bb5\u968e\u306b\u6cbf\u3046\u7d30\u80de\u72b6\u614b\u3068\u5206\u5c90\u3057\u305f\u7cfb\u8b5c\u3092\u542b\u3093\u3067\u3044\u308b[8]<\/a>\u3002Iuchi \u3068 Hamada \u306f\u3053\u306e\u516c\u958b\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u7528\u3044\u3001Monocle3 \u3067\u8ecc\u8de1\u3068\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u518d\u63a8\u5b9a\u3057\u305f\u3046\u3048\u3067\u3001scLS \u306e dynamic expression test \u3068 tradeSeq \u306e startVsEndTest \u304c\u3069\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u5f37\u304f\u691c\u51fa\u3059\u308b\u304b\u3092\u6bd4\u8f03\u3057\u305f[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

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\n

5. \u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3067\u306f\u3001\u300c\u767a\u73fe\u91cf\u306e\u5dee\u300d\u3060\u3051\u3067\u306a\u304f\u300c\u5909\u308f\u308a\u65b9\u306e\u5dee\u300d\u3082\u6bd4\u8f03\u3067\u304d\u308b<\/h2>\n

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\u6761\u4ef6\u5dee\u306e\u5f62<\/th>\n\u4e00\u70b9\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u6bd4\u8f03\u3067\u898b\u3048\u308b\u3053\u3068<\/th>\n\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u3068\u898b\u3048\u308b\u3053\u3068<\/th>\n<\/tr>\n<\/thead>\n
\u5e38\u306b\u4e00\u65b9\u304c\u9ad8\u3044<\/td>\n\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u6642\u70b9\u3092\u5927\u304d\u304f\u9078\u3070\u306a\u304f\u3066\u3082\u5dee\u3092\u6349\u3048\u3084\u3059\u3044\u3002<\/td>\n\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u901a\u3058\u3066\u767a\u73fe\u6c34\u6e96\u304c\u305a\u308c\u3066\u3044\u308b\u3053\u3068\u3092\u78ba\u8a8d\u3067\u304d\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u30d4\u30fc\u30af\u6642\u671f\u304c\u305a\u308c\u308b<\/td>\n\u30d4\u30fc\u30af\u304b\u3089\u5916\u308c\u305f\u6642\u70b9\u3067\u306f\u5dee\u304c\u5c0f\u3055\u304f\u898b\u3048\u308b\u3053\u3068\u304c\u3042\u308b\u3002<\/td>\n\u767a\u73fe\u4e0a\u6607\u3068\u4f4e\u4e0b\u306e\u6642\u671f\u3092\u542b\u3080\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u306e\u9055\u3044\u3068\u3057\u3066\u6349\u3048\u3089\u308c\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u4e00\u65b9\u3060\u3051\u4e2d\u76e4\u3067\u4e0a\u304c\u308b<\/td>\n\u521d\u671f\u3084\u7d42\u76e4\u3060\u3051\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u3068\u5dee\u304c\u6d88\u3048\u308b\u3053\u3068\u304c\u3042\u308b\u3002<\/td>\n\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306e\u9014\u4e2d\u3060\u3051\u306b\u5b58\u5728\u3059\u308b\u6761\u4ef6\u5dee\u3092\u691c\u51fa\u5bfe\u8c61\u306b\u542b\u3081\u3089\u308c\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u7d42\u76e4\u3060\u3051\u5dee\u304c\u751f\u3058\u308b<\/td>\n\u7d42\u70b9\u4ed8\u8fd1\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u3068\u76f8\u6027\u304c\u3088\u3044\u3002<\/td>\n\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u306e\u4e2d\u3067\u7d42\u76e4\u306b\u5dee\u304c\u96c6\u4e2d\u3057\u3066\u3044\u308b\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3068\u3057\u3066\u6271\u3048\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

\u539f\u8ad6\u6587\u306f\u3001\u3053\u306e shifted expression test \u3092\u30a2\u30d5\u30ea\u30ab\u30c8\u30ea\u30d1\u30ce\u30bd\u30fc\u30de Trypanosoma brucei<\/em> \u306e\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u9069\u7528\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002T. brucei<\/em> \u306f\u54fa\u4e73\u985e\u5bbf\u4e3b\u5185\u3067\u5897\u6b96\u3059\u308b slender form \u304b\u3089\u3001\u30c4\u30a7\u30c4\u30a7\u30d0\u30a8\u3078\u306e\u4f1d\u64ad\u306b\u9069\u3057\u305f stumpy form \u3078\u72b6\u614b\u3092\u79fb\u3059\u3002Briggs \u3089\u306f 8,599 \u500b\u306e\u5bc4\u751f\u866b\u306b\u3064\u3044\u3066\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u306e\u8ee2\u5199\u72b6\u614b\u3092\u6e2c\u5b9a\u3057\u3001\u7d30\u80de\u5468\u671f\u3068 slender form \u304b\u3089 stumpy form \u3078\u306e\u5206\u5316\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u3092\u518d\u69cb\u6210\u3057\u305f[9]<\/a>\u3002\u3053\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u306f\u3001\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u3092\u5236\u5fa1\u3059\u308b RNA \u7d50\u5408\u30bf\u30f3\u30d1\u30af\u8cea ZC3H20 \u3092\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3057\u305f\u6761\u4ef6\u3082\u542b\u307e\u308c\u3066\u3044\u308b\u3002<\/p>\n

ZC3H20 \u306f\u3053\u306e\u6bd4\u8f03\u3092\u8003\u3048\u308b\u3046\u3048\u3067\u90fd\u5408\u306e\u3088\u3044\u5bfe\u8c61\u3067\u3042\u308b\u3002ZC3H20 \u306f\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u5bfe\u8c61\u305d\u306e\u3082\u306e\u3067\u3042\u308b\u305f\u3081\u3001\u91ce\u751f\u578b\u3068\u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u304c\u691c\u51fa\u3055\u308c\u308b\u3053\u3068\u3092\u671f\u5f85\u3067\u304d\u308b\u3002\u672a\u77e5\u306e\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u300c\u672c\u5f53\u306b\u5dee\u304c\u3042\u308b\u304b\u300d\u3092\u63a8\u6e2c\u3059\u308b\u5834\u5408\u3068\u306f\u7570\u306a\u308a\u3001\u5c11\u306a\u304f\u3068\u3082 ZC3H20 \u81ea\u4f53\u306b\u3064\u3044\u3066\u306f\u3001\u65e2\u77e5\u306e\u5b9f\u9a13\u64cd\u4f5c\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u5404\u691c\u5b9a\u304c\u3069\u306e\u3088\u3046\u306b\u53cd\u5fdc\u3059\u308b\u304b\u3092\u78ba\u8a8d\u3067\u304d\u308b\u3002<\/p>\n

Iuchi \u3068 Hamada \u306f\u3001\u3053\u306e ZC3H20 \u306b\u3064\u3044\u3066 scLS \u306e shifted expression test \u3068\u3001tradeSeq \u306e patternTest\u3001earlyDETest\u3001diffEndTest \u3092\u6bd4\u8f03\u3057\u305f[6]<\/a>\u3002patternTest \u306f\u8ecc\u8de1\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u5168\u4f53\u306e\u9055\u3044\u3092\u8a55\u4fa1\u3057\u3001earlyDETest \u306f\u5206\u5c90\u4ed8\u8fd1\u306e\u65e9\u3044\u6bb5\u968e\u306b\u73fe\u308c\u308b\u7cfb\u8b5c\u9593\u5dee\u3092\u8abf\u3079\u3001diffEndTest \u306f\u8ecc\u8de1\u306e\u7d42\u7aef\u4ed8\u8fd1\u306b\u304a\u3051\u308b\u767a\u73fe\u5dee\u3092\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u3002\u305d\u308c\u305e\u308c\u540c\u3058 ZC3H20 \u3092\u5165\u529b\u3057\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001\u691c\u5b9a\u304c\u898b\u3066\u3044\u308b\u8ecc\u8de1\u4e0a\u306e\u7bc4\u56f2\u3068\u66f2\u7dda\u306e\u7279\u5fb4\u306f\u7570\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

\u7d50\u679c\u3082\u4e00\u69d8\u3067\u306f\u306a\u304b\u3063\u305f\u3002ZC3H20 \u306f scLS\u3001patternTest\u3001earlyDETest \u3067\u306f\u975e\u5e38\u306b\u5c0f\u3055\u3044 P \u5024\u3092\u793a\u3057\u305f\u4e00\u65b9\u3001\u7d42\u70b9\u4ed8\u8fd1\u306e\u5dee\u306b\u91cd\u70b9\u3092\u7f6e\u304f diffEndTest \u3067\u306f\u6709\u610f\u6027\u304c\u76f8\u5bfe\u7684\u306b\u5f31\u304b\u3063\u305f[6]<\/a>\u3002\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3055\u308c\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u306a\u306e\u3060\u304b\u3089\u6761\u4ef6\u9593\u306e\u9055\u3044\u305d\u306e\u3082\u306e\u304c\u5b58\u5728\u3057\u306a\u3044\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u305d\u308c\u3067\u3082\u691c\u5b9a\u7d50\u679c\u306b\u5dee\u304c\u751f\u3058\u308b\u306e\u306f\u3001ZC3H20 \u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u304c\u8ecc\u8de1\u306e\u3069\u3053\u306b\u3001\u3069\u306e\u3088\u3046\u306a\u5f62\u3067\u73fe\u308c\u308b\u304b\u3092\u5404\u691c\u5b9a\u304c\u7570\u306a\u308b\u65b9\u6cd5\u3067\u8981\u7d04\u3057\u3066\u3044\u308b\u304b\u3089\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u7d50\u679c\u306f\u3001P \u5024\u3092\u300c\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u4ed8\u968f\u3057\u305f\u56fa\u5b9a\u7684\u306a\u91cd\u8981\u5ea6\u300d\u306e\u3088\u3046\u306b\u8aad\u3080\u3068\u8aa4\u89e3\u3057\u3084\u3059\u3044\u3053\u3068\u3082\u793a\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002\u540c\u3058\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u540c\u3058\u907a\u4f1d\u5b50\u304c\u542b\u307e\u308c\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001patternTest \u304c\u554f\u3046\u300c\u66f2\u7dda\u5168\u4f53\u306f\u9055\u3046\u304b\u300d\u3068\u3001diffEndTest \u304c\u554f\u3046\u300c\u7d42\u76e4\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u306f\u9055\u3046\u304b\u300d\u306f\u5225\u306e\u4eee\u8aac\u3067\u3042\u308b\u3002\u524d\u8005\u3067\u6975\u3081\u3066\u5c0f\u3055\u3044 P \u5024\u304c\u5f97\u3089\u308c\u3001\u5f8c\u8005\u3067\u305d\u308c\u307b\u3069\u5c0f\u3055\u304f\u306a\u3089\u306a\u3044\u3053\u3068\u306b\u77db\u76fe\u306f\u306a\u3044\u3002P \u5024\u306f\u907a\u4f1d\u5b50\u305d\u306e\u3082\u306e\u306e\u5c5e\u6027\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u5b9a\u7fa9\u3055\u308c\u305f\u5e30\u7121\u4eee\u8aac\u3068\u89b3\u6e2c\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u7d44\u307f\u5408\u308f\u305b\u304b\u3089\u5f97\u3089\u308c\u308b\u91cf\u3060\u304b\u3089\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

shifted expression test \u306e\u7279\u5fb4\u306f\u3001\u3053\u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u3092\u6642\u9593\u9818\u57df\u306e\u5bfe\u5fdc\u70b9\u3054\u3068\u306e\u5dee\u3068\u3057\u3066\u76f4\u63a5\u8a08\u7b97\u3059\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u5404\u6761\u4ef6\u306e\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092 Lomb\u2013Scargle periodogram \u3078\u5909\u63db\u3057\u3066\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u3068\u3053\u308d\u306b\u3042\u308b[6]<\/a>\u3002\u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3067\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u306e\u5f62\u304c\u5909\u308f\u308c\u3070\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u306e\u30d1\u30ef\u30fc\u30b9\u30da\u30af\u30c8\u30eb\u306b\u3082\u9055\u3044\u304c\u751f\u3058\u308b\u3002\u305d\u306e\u5dee\u3092\u7528\u3044\u308b\u3053\u3068\u3067\u3001\u300c\u3042\u308b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3067\u4f55\u30ab\u30a6\u30f3\u30c8\u9055\u3063\u305f\u304b\u300d\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u5168\u4f53\u3092\u901a\u3058\u3066\u767a\u73fe\u52d5\u614b\u304c\u5909\u5316\u3057\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u62bd\u51fa\u3067\u304d\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u8a2d\u8a08\u306f\u3001\u4e8c\u6761\u4ef6\u306e\u8ecc\u8de1\u304c\u5358\u7d14\u306a\u4e00\u672c\u7dda\u3067\u306f\u306a\u3044\u5834\u5408\u306b\u3082\u610f\u5473\u3092\u6301\u3064\u3002\u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u304c\u3068\u3082\u306b\u5206\u5c90\u69cb\u9020\u3092\u6301\u3064\u3068\u304d\u3001\u7cfb\u8b5c\u3054\u3068\u306e\u6bd4\u8f03\u3067\u306f\u300c\u91ce\u751f\u578b\u306e\u679d A \u306f\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u306e\u3069\u306e\u679d\u306b\u5bfe\u5fdc\u3059\u308b\u306e\u304b\u300d\u3092\u5148\u306b\u6c7a\u3081\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002\u6761\u4ef6\u306b\u3088\u3063\u3066\u5206\u5c90\u306e\u5f62\u3001\u679d\u306e\u9577\u3055\u3001\u7d30\u80de\u5bc6\u5ea6\u304c\u5909\u308f\u308c\u3070\u3001\u3053\u306e\u5bfe\u5fdc\u306f\u5fc5\u305a\u3057\u3082\u81ea\u660e\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u5bfe\u5fdc\u4ed8\u3051\u3092\u8aa4\u308c\u3070\u3001\u672c\u6765\u7570\u306a\u308b\u72b6\u614b\u3092\u540c\u3058\u7cfb\u8b5c\u3068\u3057\u3066\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u3053\u3068\u306b\u306a\u308a\u3001\u305d\u306e\u5f8c\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u5dee\u3082\u5bfe\u5fdc\u95a2\u4fc2\u306e\u4eee\u5b9a\u306b\u5f15\u304d\u305a\u3089\u308c\u308b\u3002<\/p>\n

scLS \u306f\u3053\u306e\u679d\u540c\u58eb\u306e\u4e00\u5bfe\u4e00\u5bfe\u5fdc\u3092\u524d\u63d0\u3068\u305b\u305a\u3001\u5404\u6761\u4ef6\u306b\u3064\u3044\u3066\u5f97\u3089\u308c\u305f\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u304b\u3089\u907a\u4f1d\u5b50\u5358\u4f4d\u306e shifted expression \u3092\u691c\u5b9a\u3067\u304d\u308b[6]<\/a>\u3002\u6570\u5343\u304b\u3089\u6570\u4e07\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u4e2d\u304b\u3089\u3001\u6761\u4ef6\u3092\u5909\u3048\u305f\u3053\u3068\u3067\u767a\u73fe\u52d5\u614b\u5168\u4f53\u304c\u5909\u5316\u3057\u305f\u5019\u88dc\u3092\u5148\u306b\u7d5e\u308a\u8fbc\u307f\u305f\u3044\u5834\u5408\u306b\u306f\u3001\u5bfe\u5fdc\u3059\u308b\u679d\u3092\u907a\u4f1d\u5b50\u3054\u3068\u306b\u8abf\u3079\u308b\u524d\u6bb5\u968e\u3068\u3057\u3066\u4f7f\u3048\u308b\u3002\u5206\u5c90\u69cb\u9020\u306e\u9055\u3044\u3092\u5438\u53ce\u3057\u305f\u3046\u3048\u3067\u3001\u307e\u305a\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u96c6\u5408\u3092\u5f97\u308b\u3068\u3044\u3046\u4f4d\u7f6e\u3065\u3051\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\u305d\u306e\u5229\u4fbf\u6027\u306b\u306f\u3001\u5225\u306e\u89e3\u6790\u8ab2\u984c\u304c\u6b8b\u308b\u3002scLS \u304c\u3042\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u6709\u610f\u306a shifted expression \u3092\u8fd4\u3057\u3066\u3082\u3001\u300c\u3069\u306e\u679d\u306e\u3069\u306e\u533a\u9593\u3067\u9055\u3044\u304c\u751f\u3058\u305f\u304b\u300d\u306f\u305d\u306e\u7d71\u8a08\u91cf\u3060\u3051\u304b\u3089\u306f\u5206\u304b\u3089\u306a\u3044\u3002\u91ce\u751f\u578b\u306e\u5de6\u679d\u3060\u3051\u3067\u767a\u73fe\u304c\u4e0a\u304c\u3063\u305f\u5834\u5408\u3082\u3001\u8907\u6570\u306e\u679d\u3067\u5c0f\u3055\u306a\u5909\u5316\u304c\u7a4d\u307f\u91cd\u306a\u3063\u305f\u5834\u5408\u3082\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3068\u3057\u3066\u5dee\u304c\u3042\u308c\u3070\u5019\u88dc\u306b\u306a\u308a\u5f97\u308b\u3002\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u306e\u5dee\u3092\u679d\u5bfe\u5fdc\u306a\u3057\u3067\u691c\u51fa\u3059\u308b\u3053\u3068\u3068\u3001\u5dee\u306e\u767a\u751f\u4f4d\u7f6e\u3092\u5c40\u6240\u5316\u3059\u308b\u3053\u3068\u306f\u5225\u306e\u89e3\u6790\u8ab2\u984c\u3067\u3042\u308a\u3001\u5f8c\u8005\u3092\u77e5\u308b\u306b\u306f\u7cfb\u8b5c\u3054\u3068\u306e\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3084\u5206\u5c90\u4f4d\u7f6e\u3092\u660e\u793a\u7684\u306b\u8abf\u3079\u308b\u8ffd\u52a0\u89e3\u6790\u304c\u5fc5\u8981\u306b\u306a\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

ZC3H20 \u306e\u4f8b\u304b\u3089\u5f97\u3089\u308c\u308b\u306e\u306f\u3001\u300cscLS \u306a\u3089\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3092\u6b63\u3057\u304f\u898b\u3064\u3051\u3089\u308c\u308b\u300d\u3068\u3044\u3046\u3060\u3051\u306e\u78ba\u8a8d\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u540c\u3058\u65e2\u77e5\u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u3082\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u898b\u308b\u304b\u3001\u5206\u5c90\u521d\u671f\u3092\u898b\u308b\u304b\u3001\u7d42\u70b9\u3092\u898b\u308b\u304b\u306b\u3088\u3063\u3066\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u5f37\u3055\u304c\u5909\u308f\u308b\u3068\u3044\u3046\u5177\u4f53\u4f8b\u306b\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u6761\u4ef6\u5dee\u3092\u4e00\u3064\u306e\u6642\u70b9\u306b\u56fa\u5b9a\u3059\u308c\u3070\u3001\u305d\u306e\u6642\u70b9\u306b\u6b8b\u3089\u306a\u304b\u3063\u305f\u5909\u5316\u306f\u5f31\u304f\u898b\u3048\u308b\u3002\u904e\u7a0b\u5168\u4f53\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308c\u3070\u3001\u305d\u306e\u9014\u4e2d\u306b\u73fe\u308c\u308b\u5dee\u3082\u542b\u3081\u3089\u308c\u308b\u4e00\u65b9\u3001\u5dee\u304c\u751f\u3058\u305f\u4f4d\u7f6e\u306b\u3064\u3044\u3066\u306f\u5225\u306e\u89e3\u6790\u304c\u5fc5\u8981\u306b\u306a\u308b\u3002\u3069\u3061\u3089\u306e\u60c5\u5831\u3092\u5fc5\u8981\u3068\u3059\u308b\u304b\u306b\u3088\u3063\u3066\u3001\u9078\u3076\u691c\u5b9a\u3082\u5909\u308f\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u3053\u307e\u3067\u306e Drosophila \u3068 T. brucei<\/em> \u306e\u89e3\u6790\u3092\u4e26\u3079\u308b\u3068\u3001scLS \u304c\u72d9\u3046\u7bc4\u56f2\u304c\u306f\u3063\u304d\u308a\u3059\u308b\u3002dynamic expression test \u306f\u300c\u4e00\u3064\u306e\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306e\u9014\u4e2d\u3067\u767a\u73fe\u3057\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u3092\u63a2\u3057\u3001shifted expression test \u306f\u300c\u6761\u4ef6\u3092\u5909\u3048\u308b\u3068\u3001\u305d\u306e\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u306e\u4ed5\u65b9\u307e\u3067\u5909\u308f\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u3092\u63a2\u3059\u3002\u3044\u305a\u308c\u3082\u3001\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u767a\u73fe\u91cf\u3060\u3051\u3067\u306f\u6d88\u3048\u3066\u3057\u307e\u3046\u60c5\u5831\u3092\u904e\u7a0b\u304b\u3089\u62fe\u3046\u305f\u3081\u306e\u691c\u5b9a\u3067\u3042\u308b\u3002\u305f\u3060\u3057\u3001\u62fe\u3048\u308b\u5f62\u304c\u5897\u3048\u305f\u3053\u3068\u306f\u3001\u65e2\u5b58\u6cd5\u3088\u308a\u5e38\u306b\u9ad8\u3044\u7cbe\u5ea6\u3067\u751f\u7269\u5b66\u7684\u306b\u6b63\u3057\u3044\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u7279\u5b9a\u3067\u304d\u308b\u3053\u3068\u3092\u610f\u5473\u3057\u306a\u3044\u3002\u6b21\u306b\u78ba\u8a8d\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u306e\u306f\u3001\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u4e0a\u3067\u306e\u6027\u80fd\u6bd4\u8f03\u3068\u3001\u305d\u306e\u8a55\u4fa1\u3092\u3069\u3053\u307e\u3067\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3078\u4e00\u822c\u5316\u3067\u304d\u308b\u304b\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\n

6. scLS \u306f\u65e2\u5b58\u6cd5\u3092\u7f6e\u304d\u63db\u3048\u308b\u4e07\u80fd\u6cd5\u3067\u306f\u306a\u3044<\/h2>\n

\u65b0\u3057\u3044\u89e3\u6790\u6cd5\u3092\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u3068\u304d\u3001\u300c\u65e2\u5b58\u6cd5\u3088\u308a\u9ad8\u3044 AUROC \u3092\u51fa\u3057\u305f\u304b\u300d\u3068\u3044\u3046\u6bd4\u8f03\u306f\u5206\u304b\u308a\u3084\u3059\u3044\u3002\u3057\u304b\u3057\u3001scLS \u306e\u4f4d\u7f6e\u4ed8\u3051\u3092\u305d\u306e\u4e00\u8ef8\u3060\u3051\u3067\u5224\u65ad\u3059\u308b\u3068\u3001\u3053\u306e\u624b\u6cd5\u304c\u4f55\u3092\u6539\u5584\u3057\u3001\u4f55\u3092\u6539\u5584\u3057\u3066\u3044\u306a\u3044\u306e\u304b\u3092\u53d6\u308a\u9055\u3048\u308b\u3002\u539f\u8ad6\u6587\u306f scLS \u3092\u65e2\u5b58\u6cd5\u306e\u5168\u9762\u7684\u306a\u7f6e\u304d\u63db\u3048\u3068\u306f\u4f4d\u7f6e\u4ed8\u3051\u3066\u304a\u3089\u305a\u3001\u3068\u304f\u306b\u4e00\u904e\u6027\u30fb\u975e\u5358\u8abf\u306a\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u542b\u3080\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u9ad8\u901f\u306b\u7d5e\u308a\u8fbc\u307f\u3001\u305d\u306e\u5f8c\u306b\u679d\u3054\u3068\u306e\u8a73\u7d30\u89e3\u6790\u3084\u5225\u306e\u7d71\u8a08\u624b\u6cd5\u3078\u6e21\u3059\u4e00\u6b21\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u3068\u3057\u3066\u306e\u5229\u7528\u3092\u60f3\u5b9a\u3057\u3066\u3044\u308b[6]<\/a>\u3002\u524d\u7ae0\u307e\u3067\u3067\u898b\u305f\u3088\u3046\u306b\u3001scLS \u306e\u5f37\u307f\u306f\u3001\u3059\u3079\u3066\u306e\u767a\u73fe\u5dee\u3092\u4e00\u3064\u306e\u57fa\u6e96\u3067\u3088\u308a\u6b63\u78ba\u306b\u6e2c\u308b\u3053\u3068\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u5dee\u3060\u3051\u3067\u306f\u5f31\u304f\u898b\u3048\u308b\u5909\u5316\u3092\u5225\u306e\u8868\u73fe\u304b\u3089\u62fe\u3048\u308b\u3053\u3068\u306b\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\u539f\u8ad6\u6587\u306e\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067\u306f\u3001\u65e2\u77e5\u306e\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u6301\u3064\u4eba\u5de5\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u4f5c\u308a\u3001scLS\u3001tradeSeq\u3001Lamian\u3001PseudotimeDE \u306a\u3069\u304c\u771f\u306e\u767a\u73fe\u5dee\u3092\u3069\u306e\u7a0b\u5ea6\u8b58\u5225\u3067\u304d\u308b\u304b\u3092 AUROC \u3067\u6bd4\u8f03\u3057\u3066\u3044\u308b[6]<\/a>\u3002\u3053\u3053\u3067 AUROC \u306f\u3001\u771f\u306b\u5909\u5316\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3068\u5909\u5316\u3057\u306a\u3044\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u3001\u691c\u5b9a\u7d71\u8a08\u91cf\u3084 P \u5024\u306b\u3088\u3063\u3066\u3069\u306e\u7a0b\u5ea6\u6b63\u3057\u304f\u9806\u4f4d\u4ed8\u3051\u3067\u304d\u308b\u304b\u3092\u8868\u3059\u30021 \u306b\u8fd1\u3044\u307b\u3069\u8b58\u5225\u6027\u80fd\u304c\u9ad8\u304f\u30010.5 \u306a\u3089\u7121\u4f5c\u70ba\u306a\u9806\u4f4d\u4ed8\u3051\u306b\u8fd1\u3044\u3002<\/p>\n

\u6bd4\u8f03\u7d50\u679c\u306f\u3001scLS \u304c\u3059\u3079\u3066\u306e\u6761\u4ef6\u3067\u6700\u9ad8\u3060\u3063\u305f\u3068\u3044\u3046\u5f62\u306b\u306f\u306a\u3063\u3066\u3044\u306a\u3044\u3002\u6bd4\u8f03\u7684\u5358\u7d14\u306a\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u6761\u4ef6\u3067\u306f\u8907\u6570\u306e\u624b\u6cd5\u304c\u9ad8\u3044 AUROC \u3092\u793a\u3057\u3001\u6761\u4ef6\u306b\u3088\u3063\u3066\u306f scLS \u3082\u9ad8\u6027\u80fd\u3060\u3063\u305f\u3002\u4e00\u65b9\u3001PseudotimeDE \u306e\u8a55\u4fa1\u7528\u306b\u8a2d\u8a08\u3055\u308c\u305f\u3001\u3088\u308a\u96e3\u3057\u3044\u30d9\u30f3\u30c1\u30de\u30fc\u30af\u3067\u306f PseudotimeDE \u304c\u5168\u6761\u4ef6\u3067\u6700\u3082\u9ad8\u3044\u6027\u80fd\u3092\u793a\u3057\u305f[6]<\/a>\u3002\u3053\u306e\u7d50\u679c\u304b\u3089\u8a00\u3048\u308b\u306e\u306f\u3001scLS \u304c\u65e2\u5b58\u6cd5\u3092\u4e00\u5f8b\u306b\u4e0a\u56de\u3063\u305f\u3053\u3068\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u8907\u96d1\u306a\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u62fe\u3046\u80fd\u529b\u3092\u6301\u3061\u306a\u304c\u3089\u3001\u5c11\u306a\u304f\u3068\u3082\u8907\u6570\u306e\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u6761\u4ef6\u3067\u65e2\u5b58\u6cd5\u3068\u7af6\u4e89\u53ef\u80fd\u306a\u8b58\u5225\u6027\u80fd\u3092\u7dad\u6301\u3057\u305f\u3068\u3044\u3046\u7bc4\u56f2\u307e\u3067\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

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\u3053\u306e\u901f\u5ea6\u5dee\u306f\u3001\u4e00\u6b21\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u3068\u3044\u3046\u7528\u9014\u3068\u7d50\u3073\u4ed8\u3051\u3066\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u3067\u306f\u3001\u4e00\u3064\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3060\u3051\u3092\u8abf\u3079\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u6570\u5343\u304b\u3089\u6570\u4e07\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u540c\u3058\u8ecc\u8de1\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u3002\u3055\u3089\u306b\u6761\u4ef6\u6bd4\u8f03\u3084\u8907\u6570\u306e\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u6cd5\u3092\u8a66\u305b\u3070\u3001\u540c\u3058\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u56de\u6570\u3082\u5897\u3048\u308b\u30021 \u907a\u4f1d\u5b50\u3054\u3068\u306e\u8a08\u7b97\u304c\u8907\u96d1\u3067\u306a\u304f\u3066\u3082\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u6570\u3068\u89e3\u6790\u6761\u4ef6\u304c\u7a4d\u307f\u4e0a\u304c\u308c\u3070\u7dcf\u8a08\u7b97\u91cf\u306f\u5927\u304d\u304f\u306a\u308b\u3002\u305d\u306e\u524d\u6bb5\u968e\u3067\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u77ed\u6642\u9593\u306b\u7d5e\u308c\u308b\u306a\u3089\u3001\u305d\u306e\u5f8c\u306b\u8a08\u7b97\u8ca0\u8377\u306e\u9ad8\u3044\u679d\u5225\u89e3\u6790\u3084\u53ef\u8996\u5316\u3092\u9069\u7528\u3059\u308b\u5bfe\u8c61\u3092\u6e1b\u3089\u305b\u308b\u3002<\/p>\n

\u305f\u3060\u3057\u30011000 \u7d30\u80de\u30fb2000 \u907a\u4f1d\u5b50\u30fb1 \u30b3\u30a2\u3068\u3044\u3046\u8ad6\u6587\u4e2d\u306e\u30d9\u30f3\u30c1\u30de\u30fc\u30af\u6761\u4ef6\u304b\u3089\u3001\u4efb\u610f\u306e\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u898f\u6a21\u3067\u540c\u3058\u901f\u5ea6\u5dee\u304c\u7dad\u6301\u3055\u308c\u308b\u3068\u306f\u8a00\u3048\u306a\u3044\u3002\u7d30\u80de\u6570\u304c\u5897\u3048\u308c\u3070\u30d4\u30ea\u30aa\u30c9\u30b0\u30e9\u30e0\u3092\u8a08\u7b97\u3059\u308b\u5165\u529b\u70b9\u3082\u5897\u3048\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u6570\u304c\u5897\u3048\u308c\u3070\u691c\u5b9a\u56de\u6570\u3082\u5897\u3048\u308b\u3002\u5206\u5c90\u69cb\u9020\u306e\u8907\u96d1\u3055\u3001\u30e1\u30e2\u30ea\u4f7f\u7528\u91cf\u3001\u4e26\u5217\u5316\u306e\u6709\u7121\u3001\u524d\u51e6\u7406\u306e\u5b9f\u88c5\u3082\u5b9f\u904b\u7528\u6642\u9593\u306b\u5f71\u97ff\u3059\u308b\u3002\u8ad6\u6587\u3067\u78ba\u8a8d\u3067\u304d\u308b\u306e\u306f\u3001\u6307\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u6761\u4ef6\u3067\u306f scLS \u306e\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u304c\u77ed\u304b\u3063\u305f\u3068\u3044\u3046\u4e8b\u5b9f\u3067\u3042\u308a\u3001\u305d\u308c\u4ee5\u4e0a\u306e\u898f\u6a21\u3067\u306e\u901f\u5ea6\u306f\u5225\u9014\u6e2c\u5b9a\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\u7cbe\u5ea6\u6bd4\u8f03\u306b\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u304c\u4f7f\u308f\u308c\u308b\u306e\u306b\u306f\u7406\u7531\u304c\u3042\u308b\u3002Drosophila \u3084 T. brucei<\/em> \u306e\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u306f\u3001\u5404\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u300c\u3053\u308c\u306f\u771f\u306b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4f9d\u5b58\u3067\u3042\u308b\u300d\u300c\u3053\u308c\u306f\u771f\u306b\u5909\u5316\u3057\u306a\u3044\u300d\u3068\u3044\u3046\u5b8c\u5168\u306a\u6b63\u89e3\u8868\u3092\u6301\u3066\u306a\u3044\u3002\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u898b\u308c\u3070\u5019\u88dc\u306f\u5206\u304b\u3063\u3066\u3082\u3001\u5168\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u771f\u507d\u3092\u78ba\u5b9a\u3057\u305f\u6b63\u89e3\u30e9\u30d9\u30eb\u306f\u5b58\u5728\u3057\u306a\u3044\u3002\u305d\u306e\u72b6\u614b\u3067\u306f\u3001\u3042\u308b\u624b\u6cd5\u304c\u62fe\u3063\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u6570\u3092\u6570\u3048\u3066\u3082\u3001\u305d\u308c\u304c\u9ad8\u611f\u5ea6\u306a\u306e\u304b\u8aa4\u691c\u51fa\u304c\u591a\u3044\u306e\u304b\u3092\u53b3\u5bc6\u306b\u306f\u533a\u5225\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067\u306f\u3001\u3053\u306e\u5236\u7d04\u3092\u9006\u5411\u304d\u306b\u51e6\u7406\u3059\u308b\u3002\u6700\u521d\u306b\u300c\u3069\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u5909\u5316\u3055\u305b\u308b\u304b\u300d\u300c\u8ecc\u8de1\u3092\u3069\u306e\u5f62\u306b\u3059\u308b\u304b\u300d\u300c\u7d30\u80de\u3092\u3069\u3053\u3078\u914d\u7f6e\u3059\u308b\u304b\u300d\u3092\u6c7a\u3081\u3001\u305d\u306e\u6761\u4ef6\u304b\u3089\u4eba\u5de5\u7684\u306a\u30ab\u30a6\u30f3\u30c8\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u751f\u6210\u3059\u308b\u3002\u751f\u6210\u5074\u304c\u6b63\u89e3\u3092\u77e5\u3063\u3066\u3044\u308b\u305f\u3081\u3001\u89e3\u6790\u6cd5\u304c\u3069\u306e\u7a0b\u5ea6\u305d\u306e\u6b63\u89e3\u3092\u56de\u53ce\u3067\u304d\u305f\u304b\u3092 AUROC \u306a\u3069\u3067\u5b9a\u91cf\u6bd4\u8f03\u3067\u304d\u308b\u3002<\/p>\n

Splatter \u306f\u3001\u5b9f\u969b\u306e\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u5e73\u5747\u767a\u73fe\u91cf\u3001\u5206\u6563\u3001\u30bc\u30ed\u5024\u306e\u983b\u5ea6\u306a\u3069\u306e\u7279\u5fb4\u3092\u63a8\u5b9a\u3057\u3001\u305d\u308c\u3089\u3092\u53cd\u6620\u3057\u305f\u4eba\u5de5\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u751f\u6210\u3059\u308b\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u57fa\u76e4\u3067\u3042\u308b[10]<\/a>\u3002PROSSTT \u306f\u3055\u3089\u306b\u3001\u65e2\u77e5\u306e\u5206\u5c90\u69cb\u9020\u3068\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u6301\u3064\u8907\u96d1\u306a\u5206\u5316\u904e\u7a0b\u3092\u8a2d\u5b9a\u3057\u3001\u305d\u306e\u8ecc\u8de1\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u304c\u5909\u308f\u308b\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u751f\u6210\u3067\u304d\u308b[11]<\/a>\u3002\u3053\u306e\u7a2e\u306e\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3092\u4f7f\u3048\u3070\u3001\u300c\u672c\u5f53\u306e\u8ecc\u8de1\u300d\u300c\u672c\u5f53\u306b\u5909\u5316\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u300d\u300c\u771f\u306e\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u300d\u3092\u77e5\u3063\u305f\u72b6\u614b\u3067\u3001\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u6cd5\u3068\u4e0b\u6d41\u691c\u5b9a\u306e\u4e21\u65b9\u3092\u8a55\u4fa1\u3067\u304d\u308b\u3002<\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n\n
\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067\u56fa\u5b9a\u3067\u304d\u308b\u3082\u306e<\/th>\n\u305d\u3053\u304b\u3089\u8a55\u4fa1\u3067\u304d\u308b\u3053\u3068<\/th>\n\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3078\u79fb\u3057\u305f\u3068\u304d\u306b\u6b8b\u308b\u4e0d\u78ba\u5b9f\u6027<\/th>\n<\/tr>\n<\/thead>\n
\u771f\u306b\u5909\u5316\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50<\/td>\n\u691c\u51fa\u9806\u4f4d\u304b\u3089 AUROC \u3092\u8a08\u7b97\u3057\u3001\u624b\u6cd5\u9593\u306e\u8b58\u5225\u6027\u80fd\u3092\u6bd4\u8f03\u3067\u304d\u308b\u3002<\/td>\n\u5b9f\u751f\u7269\u3067\u306f\u5168\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u771f\u306e\u767a\u73fe\u5dee\u3092\u5b8c\u5168\u306b\u306f\u78ba\u5b9a\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u771f\u306e\u8ecc\u8de1\u69cb\u9020<\/td>\n\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u5206\u5c90\u3084\u7d30\u80de\u9806\u5e8f\u304c\u6b63\u89e3\u306b\u3069\u308c\u3060\u3051\u8fd1\u3044\u304b\u3092\u6e2c\u5b9a\u3067\u304d\u308b\u3002<\/td>\n\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u306f\u63a8\u5b9a\u8ecc\u8de1\u305d\u306e\u3082\u306e\u306e\u6b63\u89e3\u3092\u76f4\u63a5\u89b3\u6e2c\u3067\u304d\u306a\u3044\u5834\u5408\u304c\u591a\u3044\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u771f\u306e\u64ec\u4f3c\u6642\u9593<\/td>\n\u771f\u306e\u6642\u9593\u8ef8\u3092\u4e0e\u3048\u305f\u5834\u5408\u3068\u3001\u63a8\u5b9a\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u4f7f\u3063\u305f\u5834\u5408\u306e\u6027\u80fd\u5dee\u3092\u5206\u96e2\u3067\u304d\u308b\u3002<\/td>\n\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306f\u6f5c\u5728\u7684\u306a\u9032\u884c\u8ef8\u3067\u3042\u308a\u3001\u7269\u7406\u6642\u9593\u3068\u306e\u4e00\u81f4\u306f\u4fdd\u8a3c\u3055\u308c\u306a\u3044\u3002<\/td>\n<\/tr>\n
\u30ce\u30a4\u30ba\u751f\u6210\u30e2\u30c7\u30eb<\/td>\n\u30ce\u30a4\u30ba\u91cf\u3084\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u5236\u5fa1\u3057\u3001\u6761\u4ef6\u3054\u3068\u306e\u6027\u80fd\u4f4e\u4e0b\u3092\u518d\u73fe\u3067\u304d\u308b\u3002<\/td>\n\u5b9f\u7d30\u80de\u306b\u306f\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067\u660e\u793a\u3057\u3066\u3044\u306a\u3044\u6280\u8853\u5909\u52d5\u3001\u751f\u7269\u5b66\u7684\u7570\u8cea\u6027\u3001\u6a19\u672c\u5dee\u304c\u542b\u307e\u308c\u5f97\u308b\u3002<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

\u3053\u306e\u8a55\u4fa1\u65b9\u6cd5\u306b\u306f\u660e\u78ba\u306a\u9650\u754c\u3082\u3042\u308b\u3002\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067 AUROC \u304c\u9ad8\u3044\u3068\u3044\u3046\u3053\u3068\u306f\u3001\u305d\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u751f\u6210\u30e2\u30c7\u30eb\u304c\u4f5c\u3063\u305f\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u3046\u307e\u304f\u56de\u53ce\u3067\u304d\u305f\u3053\u3068\u3092\u610f\u5473\u3059\u308b\u3002\u5b9f\u969b\u306e\u7d30\u80de\u3067\u306f\u3001\u8ee2\u5199\u30d0\u30fc\u30b9\u30c8\u3001\u7d30\u80de\u5468\u671f\u3001\u500b\u4f53\u5dee\u3001\u30d0\u30c3\u30c1\u52b9\u679c\u3001\u6e2c\u5b9a\u6df1\u5ea6\u3001\u672a\u77e5\u306e\u5206\u5c90\u3001\u8907\u6570\u306e\u751f\u7269\u5b66\u7684\u904e\u7a0b\u306e\u91cd\u306a\u308a\u306a\u3069\u304c\u540c\u6642\u306b\u5b58\u5728\u3059\u308b\u3002\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u306b\u542b\u307e\u308c\u3066\u3044\u306a\u3044\u5909\u52d5\u306f\u3001\u3069\u308c\u3060\u3051 AUROC \u3092\u7cbe\u5bc6\u306b\u6bd4\u8f03\u3057\u3066\u3082\u8a55\u4fa1\u5bfe\u8c61\u306b\u306f\u306a\u3089\u306a\u3044\u3002\u539f\u8ad6\u6587\u81ea\u8eab\u3082\u3001\u4eba\u5de5\u30c7\u30fc\u30bf\u304c\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3088\u308a\u5358\u7d14\u3067\u30ce\u30a4\u30ba\u304c\u5c11\u306a\u3044\u53ef\u80fd\u6027\u3092\u9650\u754c\u3068\u3057\u3066\u6319\u3052\u3066\u3044\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3068\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u306f\u3001\u3053\u3053\u3067\u5225\u306e\u5f79\u5272\u3092\u6301\u3064\u3002Drosophila \u306e\u89e3\u6790\u306f\u3001\u4e2d\u76e4\u3067\u30d4\u30fc\u30af\u3092\u4f5c\u308b\u5177\u4f53\u7684\u306a\u907a\u4f1d\u5b50\u7fa4\u3092 scLS \u304c\u5f37\u304f\u62fe\u3046\u3068\u3044\u3046\u3001\u65b9\u6cd5\u306e\u6319\u52d5\u3092\u73fe\u5b9f\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u4e0a\u3067\u793a\u3059\u3002T. brucei<\/em> \u306e ZC3H20 \u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u306f\u3001\u65e2\u77e5\u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u306b\u5bfe\u3057\u3066\u8907\u6570\u306e\u691c\u5b9a\u304c\u7570\u306a\u308b\u53cd\u5fdc\u3092\u793a\u3059\u4f8b\u306b\u306a\u308b\u3002\u4e00\u65b9\u3001AUROC \u306e\u6bd4\u8f03\u306b\u306f\u771f\u306e\u6b63\u89e3\u304c\u5fc5\u8981\u306a\u306e\u3067\u3001\u5b9a\u91cf\u7684\u306a\u8b58\u5225\u6027\u80fd\u306e\u8a55\u4fa1\u306f\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u304c\u62c5\u3046\u3002\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3060\u3051\u3067\u3082\u3001\u4eba\u5de5\u30c7\u30fc\u30bf\u3060\u3051\u3067\u3082\u3001scLS \u306e\u6027\u8cea\u3092\u5341\u5206\u306b\u306f\u8a55\u4fa1\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u533a\u5225\u3092\u7f6e\u304f\u3068\u3001scLS \u306e\u8a55\u4fa1\u8ef8\u306f\u4e00\u3064\u3067\u306f\u306a\u304f\u306a\u308b\u3002\u7b2c\u4e00\u306b\u3001\u4e00\u904e\u6027\u30fb\u975e\u5358\u8abf\u306a\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u691c\u51fa\u5bfe\u8c61\u3078\u542b\u3081\u3089\u308c\u308b\u3002\u7b2c\u4e8c\u306b\u3001\u6761\u4ef6\u9593\u3067\u679d\u3092\u660e\u793a\u7684\u306b\u5bfe\u5fdc\u4ed8\u3051\u305a\u306b\u5168\u4f53\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u3092\u884c\u3048\u308b\u3002\u7b2c\u4e09\u306b\u3001\u8ad6\u6587\u4e2d\u306e\u6761\u4ef6\u3067\u306f\u6bd4\u8f03\u7684\u77ed\u6642\u9593\u3067\u591a\u6570\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u51e6\u7406\u3067\u304d\u308b\u3002\u7b2c\u56db\u306b\u3001\u8b58\u5225\u6027\u80fd\u306f\u8907\u6570\u306e\u65e2\u5b58\u6cd5\u3068\u7af6\u4e89\u53ef\u80fd\u3060\u304c\u3001\u30d9\u30f3\u30c1\u30de\u30fc\u30af\u306b\u3088\u3063\u3066\u6700\u826f\u6cd5\u306f\u5909\u308f\u308b\u3002\u3053\u308c\u3089\u3092\u5408\u308f\u305b\u308b\u3068\u3001scLS \u306f\u300c\u6700\u3082\u9ad8\u7cbe\u5ea6\u306a\u4e07\u80fd\u6cd5\u300d\u3068\u3044\u3046\u3088\u308a\u3001\u8907\u96d1\u306a\u767a\u73fe\u52d5\u614b\u3092\u9ad8\u901f\u306b\u5019\u88dc\u5316\u3059\u308b\u305f\u3081\u306e\u88dc\u5b8c\u7684\u306a\u9078\u629e\u80a2\u3068\u3057\u3066\u4f4d\u7f6e\u4ed8\u3051\u308b\u65b9\u304c\u539f\u8ad6\u6587\u306e\u7d50\u679c\u306b\u5408\u3046\u3002<\/p>\n

\u6b8b\u308b\u8ab2\u984c\u306f\u3001\u30b7\u30df\u30e5\u30ec\u30fc\u30b7\u30e7\u30f3\u3067\u306f\u771f\u306e\u5024\u3068\u3057\u3066\u4e0e\u3048\u3089\u308c\u308b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3084\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u304c\u3001\u5b9f\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u306f\u63a8\u5b9a\u3084\u6a19\u672c\u69cb\u9020\u306e\u4e00\u90e8\u306b\u306a\u308b\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b\u3002scLS \u304c\u8907\u96d1\u306a\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u62fe\u3048\u308b\u3053\u3068\u3068\u3001\u305d\u306e P \u5024\u304c\u3042\u3089\u3086\u308b\u5b9f\u9a13\u8a2d\u8a08\u3067\u5341\u5206\u306b\u8f03\u6b63\u3055\u308c\u308b\u3053\u3068\u306f\u5225\u306e\u554f\u984c\u306b\u306a\u308b\u3002\u6b21\u7ae0\u3067\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u540c\u3058\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u63a8\u5b9a\u3057\u3066\u518d\u3073\u691c\u5b9a\u3078\u4f7f\u3046\u3053\u3068\u3001\u8907\u6570\u306e\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3092\u3069\u3046\u6271\u3046\u304b\u3001\u5206\u5c90\u4e0a\u306e\u5dee\u3092\u3069\u3053\u307e\u3067\u5c40\u6240\u5316\u3067\u304d\u308b\u304b\u3068\u3044\u3046\u3001\u539f\u8ad6\u6587\u81ea\u8eab\u304c\u6b8b\u3057\u305f\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u5236\u7d04\u3092\u78ba\u8a8d\u3059\u308b\u3002<\/p>\n

\n

7. \u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u305d\u306e\u3082\u306e\u304c\u63a8\u5b9a\u5024\u3067\u3042\u308b\u4ee5\u4e0a\u3001\u691c\u5b9a\u306b\u3082\u9650\u754c\u304c\u6b8b\u308b<\/h2>\n

scLS \u306e\u9650\u754c\u306f\u3001\u539f\u8ad6\u6587\u306e\u8003\u5bdf\u3067\u6bd4\u8f03\u7684\u660e\u78ba\u306b\u6574\u7406\u3055\u308c\u3066\u3044\u308b\u3002\u524d\u7ae0\u307e\u3067\u3067\u898b\u305f\u5229\u70b9\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u8907\u96d1\u306a\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u62fe\u3044\u3084\u3059\u3044\u3053\u3068\u3001\u6761\u4ef6\u9593\u3067\u679d\u3092\u4e00\u5bfe\u4e00\u306b\u5bfe\u5fdc\u4ed8\u3051\u305a\u5168\u4f53\u5dee\u3092\u691c\u7d22\u3067\u304d\u308b\u3053\u3068\u3001\u8ad6\u6587\u4e2d\u306e\u6761\u4ef6\u3067\u306f\u8a08\u7b97\u6642\u9593\u304c\u77ed\u3044\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b\u3002\u4e00\u65b9\u3001\u3053\u308c\u3089\u306e\u5229\u70b9\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u305d\u306e\u3082\u306e\u304c\u63a8\u5b9a\u5024\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u3001\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u30c7\u30fc\u30bf\u304c\u8907\u6570\u306e\u500b\u4f53\u3084\u6a19\u672c\u304b\u3089\u69cb\u6210\u3055\u308c\u308b\u3053\u3068\u3001\u540c\u3058\u767a\u73fe\u884c\u5217\u3092\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u3068\u4eee\u8aac\u691c\u5b9a\u306e\u4e21\u65b9\u306b\u4f7f\u3046\u3053\u3068\u306b\u3088\u3063\u3066\u751f\u3058\u308b\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u4e0d\u78ba\u5b9f\u6027\u3092\u6d88\u3059\u3082\u306e\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002scLS \u304c\u3069\u306e\u5f62\u306e\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3092\u691c\u51fa\u3067\u304d\u308b\u304b\u3068\u3001\u305d\u306e P \u5024\u3092\u3069\u3053\u307e\u3067\u78ba\u304b\u306a\u63a8\u8ad6\u3068\u3057\u3066\u8aad\u3081\u308b\u304b\u306f\u5206\u3051\u3066\u8003\u3048\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

7.1 \u7d30\u80de\u304c\u591a\u304f\u3066\u3082\u3001\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u304c\u591a\u3044\u3068\u306f\u9650\u3089\u306a\u3044<\/h3>\n

\u7b2c\u4e00\u306e\u5236\u7d04\u306f\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\uff08biological replicate\uff09\u3001\u3059\u306a\u308f\u3061\u7570\u306a\u308b\u500b\u4f53\u3001\u57f9\u990a\u3001\u51e6\u7f6e\u5358\u4f4d\u306a\u3069\u304b\u3089\u72ec\u7acb\u306b\u53d6\u5f97\u3057\u305f\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3092\u3001\u73fe\u5728\u306e scLS \u304c\u660e\u793a\u7684\u306b\u306f\u30e2\u30c7\u30eb\u5316\u3057\u306a\u3044\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b[6]<\/a>\u3002\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u3067\u306f\u3001\u4e00\u3064\u306e\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u304b\u3089\u6570\u5343\u3001\u6570\u4e07\u306e\u7d30\u80de\u304c\u5f97\u3089\u308c\u308b\u305f\u3081\u3001\u89b3\u6e2c\u6570\u3060\u3051\u3092\u898b\u308b\u3068\u975e\u5e38\u306b\u5927\u304d\u306a\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u898b\u3048\u308b\u3002\u3057\u304b\u3057\u3001\u540c\u3058\u500b\u4f53\u304b\u3089\u5f97\u305f 5000 \u7d30\u80de\u306f\u30015000 \u500b\u306e\u72ec\u7acb\u3057\u305f\u500b\u4f53\u3092\u6e2c\u3063\u305f\u3053\u3068\u306b\u306f\u306a\u3089\u306a\u3044\u3002\u7d30\u80de\u306f\u540c\u3058\u500b\u4f53\u3001\u540c\u3058\u51e6\u7f6e\u3001\u540c\u3058\u5b9f\u9a13\u74b0\u5883\u3092\u5171\u6709\u3057\u3066\u304a\u308a\u3001\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u5358\u4f4d\u306e\u5909\u52d5\u3092\u6301\u3064\u304b\u3089\u3067\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

\u305f\u3068\u3048\u3070\u91ce\u751f\u578b 1 \u500b\u4f53\u304b\u3089 5000 \u7d30\u80de\u3001\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8 1 \u500b\u4f53\u304b\u3089 5000 \u7d30\u80de\u3092\u53d6\u5f97\u3057\u305f\u5834\u5408\u3001\u7d30\u80de\u6570\u3060\u3051\u306a\u3089\u5404\u6761\u4ef6\u306b\u5341\u5206\u306a\u89b3\u6e2c\u304c\u3042\u308b\u3088\u3046\u306b\u898b\u3048\u308b\u3002\u3057\u304b\u3057\u4e21\u6761\u4ef6\u306e\u5dee\u306b\u306f\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u306e\u52b9\u679c\u3060\u3051\u3067\u306a\u304f\u3001\u500b\u4f53\u5dee\u3001\u63a1\u53d6\u6642\u306e\u72b6\u614b\u3001\u30e9\u30a4\u30d6\u30e9\u30ea\u4f5c\u88fd\u3001\u30d0\u30c3\u30c1\u306a\u3069\u3001\u305d\u306e 2 \u500b\u4f53\u306b\u56fa\u6709\u306e\u5dee\u3082\u6df7\u3056\u308a\u5f97\u308b\u3002\u7d30\u80de\u3092\u3059\u3079\u3066\u72ec\u7acb\u306a\u53cd\u5fa9\u3068\u3057\u3066\u6271\u3048\u3070\u3001\u540c\u3058\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u306b\u5c5e\u3059\u308b\u7d30\u80de\u306e\u985e\u4f3c\u6027\u3092\u7121\u8996\u3057\u3001\u5b9f\u969b\u3088\u308a\u60c5\u5831\u91cf\u304c\u591a\u3044\u3088\u3046\u306b\u8a55\u4fa1\u3059\u308b\u5371\u967a\u304c\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

Hou \u3089\u306f\u3001\u8907\u6570\u306e\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u3092\u5bfe\u8c61\u3068\u3059\u308b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u5dee\u89e3\u6790\u306e\u7d71\u8a08\u67a0\u7d44\u307f\u3092\u63d0\u6848\u3057\u3001Lamian \u306b\u3088\u3063\u3066\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u9593\u5909\u52d5\u3092\u542b\u3081\u305f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4f9d\u5b58\u306e\u5dee\u3092\u691c\u5b9a\u3057\u3066\u3044\u308b[12]<\/a>\u3002\u3053\u3053\u3067\u6271\u308f\u308c\u3066\u3044\u308b\u306e\u306f\u3001\u300c\u7d30\u80de\u6570\u3092\u5897\u3084\u305b\u3070\u89e3\u6c7a\u3059\u308b\u300d\u554f\u984c\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u7d30\u80de\u306f\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u306e\u5185\u5074\u306b\u5165\u308c\u5b50\u306b\u306a\u3063\u3066\u3044\u308b\u305f\u3081\u3001\u7d30\u80de\u30ec\u30d9\u30eb\u306e\u5909\u52d5\u3068\u30b5\u30f3\u30d7\u30eb\u30ec\u30d9\u30eb\u306e\u5909\u52d5\u3092\u5206\u96e2\u3057\u3066\u30e2\u30c7\u30eb\u5316\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002scLS \u539f\u8ad6\u6587\u3082\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3092\u8003\u616e\u3057\u305f\u63a8\u8ad6\u3092\u4eca\u5f8c\u306e\u8ab2\u984c\u3068\u3057\u3066\u6319\u3052\u3066\u3044\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u5236\u7d04\u306f\u3001scLS \u306e\u4f7f\u7528\u5bfe\u8c61\u3092\u8003\u3048\u308b\u3068\u304d\u306b\u5b9f\u52d9\u7684\u306a\u610f\u5473\u3092\u6301\u3064\u3002\u63a2\u7d22\u7684\u306b\u4e00\u3064\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u30bb\u30c3\u30c8\u304b\u3089\u4e00\u904e\u6027\u767a\u73fe\u306e\u5019\u88dc\u3092\u9806\u4f4d\u4ed8\u3051\u3059\u308b\u7528\u9014\u3068\u3001\u8907\u6570\u500b\u4f53\u306b\u5171\u901a\u3059\u308b\u6761\u4ef6\u5dee\u3068\u3057\u3066\u7d71\u8a08\u7684\u306b\u4e00\u822c\u5316\u3059\u308b\u7528\u9014\u3067\u306f\u3001\u8981\u6c42\u3055\u308c\u308b\u63a8\u8ad6\u306e\u5f37\u3055\u304c\u9055\u3046\u3002\u524d\u8005\u3067\u306f\u907a\u4f1d\u5b50\u5019\u88dc\u306e\u4e00\u6b21\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u3068\u3057\u3066\u5229\u7528\u3067\u304d\u3066\u3082\u3001\u5f8c\u8005\u3067\u306f\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3092\u8003\u616e\u3057\u305f\u89e3\u6790\u3084\u72ec\u7acb\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u306e\u518d\u73fe\u78ba\u8a8d\u3092\u8ffd\u52a0\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b\u3002<\/p>\n

7.2 \u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u306e\u5dee\u3092\u62fe\u3048\u3066\u3082\u3001\u5dee\u304c\u751f\u3058\u305f\u679d\u307e\u3067\u306f\u5206\u304b\u3089\u306a\u3044<\/h3>\n

\u7b2c\u4e8c\u306e\u5236\u7d04\u306f\u3001\u5206\u5c90\u3057\u305f\u8ecc\u8de1\u306b\u5bfe\u3059\u308b\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u5bfe\u8c61\u3068\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u3068\u679d\u5225\u306e\u89e3\u91c8\u306e\u9055\u3044\u3067\u3042\u308b\u3002scLS \u306f\u3001\u91ce\u751f\u578b\u3068\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3067\u679d\u3092\u4e00\u5bfe\u4e00\u306b\u5bfe\u5fdc\u4ed8\u3051\u306a\u304f\u3066\u3082\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u306b\u3064\u3044\u3066\u907a\u4f1d\u5b50\u5358\u4f4d\u306e dynamic expression \u3084 shifted expression \u3092\u8a08\u7b97\u3067\u304d\u308b[6]<\/a>\u3002\u6761\u4ef6\u306b\u3088\u3063\u3066\u679d\u6570\u3084\u5206\u5c90\u5f62\u72b6\u304c\u5909\u308f\u308b\u5834\u5408\u306b\u3001\u5bfe\u5fdc\u95a2\u4fc2\u3092\u4e8b\u524d\u306b\u56fa\u5b9a\u3057\u306a\u304f\u3066\u3088\u3044\u3053\u3068\u306f\u30b9\u30af\u30ea\u30fc\u30cb\u30f3\u30b0\u4e0a\u306e\u5229\u70b9\u306b\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

\u305f\u3060\u3057\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u4e00\u3064\u306e\u7d71\u8a08\u91cf\u3078\u307e\u3068\u3081\u308b\u3068\u3001\u5dee\u304c\u751f\u3058\u305f\u5834\u6240\u306e\u60c5\u5831\u306f\u305d\u306e\u7d71\u8a08\u91cf\u3060\u3051\u304b\u3089\u5fa9\u5143\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002\u305f\u3068\u3048\u3070\u3001\u3042\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u304c\u5de6\u5074\u306e\u7cfb\u8b5c\u3060\u3051\u3067\u5927\u304d\u304f\u4e0a\u6607\u3057\u305f\u5834\u5408\u3068\u3001\u8907\u6570\u306e\u7cfb\u8b5c\u3067\u5c0f\u3055\u306a\u5909\u5316\u3092\u793a\u3057\u305f\u5834\u5408\u306e\u3069\u3061\u3089\u3067\u3082\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3068\u3057\u3066\u5341\u5206\u306a\u5909\u5316\u304c\u3042\u308c\u3070 scLS \u306f\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u691c\u51fa\u3057\u5f97\u308b\u3002\u691c\u5b9a\u7d50\u679c\u304c\u6709\u610f\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u304b\u3089\u3001\u300c\u7b2c 2 \u5206\u5c90\u306e\u53f3\u5074\u3067\u306e\u307f\u5909\u5316\u3057\u305f\u300d\u300c\u5206\u5c90\u76f4\u5f8c\u306b\u767a\u73fe\u304c\u305a\u308c\u305f\u300d\u3068\u3044\u3063\u305f\u5c40\u6240\u7684\u306a\u7d50\u8ad6\u307e\u3067\u306f\u5c0e\u3051\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u5bfe\u8c61\u3068\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u3068\u3001\u5dee\u304c\u751f\u3058\u305f\u679d\u3084\u4f4d\u7f6e\u3092\u7279\u5b9a\u3059\u308b\u89e3\u6790\u306f\u5f79\u5272\u304c\u7570\u306a\u308b\u3002\u6700\u521d\u306b\u6570\u5343\u907a\u4f1d\u5b50\u304b\u3089\u6761\u4ef6\u4f9d\u5b58\u306e\u767a\u73fe\u52d5\u614b\u3092\u6301\u3064\u5019\u88dc\u3092\u7d5e\u308a\u3001\u305d\u306e\u5f8c\u3067\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u7cfb\u8b5c\u3054\u3068\u306e\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u63cf\u304f\u3001\u5206\u5c90\u3054\u3068\u306e\u691c\u5b9a\u3092\u884c\u3046\u3001\u7d30\u80de\u578b\u30de\u30fc\u30ab\u30fc\u3068\u7167\u5408\u3059\u308b\u3068\u3044\u3063\u305f\u4e8c\u6bb5\u968e\u306e\u89e3\u6790\u304c\u5fc5\u8981\u306b\u306a\u308b\u3002scLS \u306e\u51fa\u529b\u306f\u300c\u3069\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u8a73\u3057\u304f\u898b\u308b\u304b\u300d\u3092\u6c7a\u3081\u308b\u6750\u6599\u306b\u306f\u306a\u308b\u304c\u3001\u300c\u8ecc\u8de1\u4e0a\u306e\u3069\u3053\u3067\u4f55\u304c\u8d77\u304d\u305f\u304b\u300d\u3092\u5358\u72ec\u3067\u8aac\u660e\u3059\u308b\u7d50\u679c\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

7.3 \u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u4f5c\u3063\u305f\u30c7\u30fc\u30bf\u3067\u3001\u518d\u3073\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3068\u306e\u95a2\u9023\u3092\u691c\u5b9a\u3059\u308b<\/h3>\n

\u7b2c\u4e09\u306e\u5236\u7d04\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u63a8\u5b9a\u3068\u907a\u4f1d\u5b50\u691c\u5b9a\u306b\u540c\u3058\u767a\u73fe\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u4f7f\u3046\u3053\u3068\u306b\u3088\u308b\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u4e8c\u91cd\u5229\u7528\uff08double dipping\uff09\u3067\u3042\u308b\u3002\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u3067\u306f\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u884c\u5217\u304b\u3089\u7d30\u80de\u9593\u306e\u985e\u4f3c\u6027\u3092\u8a08\u7b97\u3057\u3001\u305d\u306e\u69cb\u9020\u3092\u4f7f\u3063\u3066\u8ecc\u8de1\u3084\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3092\u63a8\u5b9a\u3059\u308b\u3002\u305d\u306e\u5f8c\u3001\u540c\u3058\u767a\u73fe\u884c\u5217\u306e\u5404\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u300c\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3068\u95a2\u9023\u3059\u308b\u304b\u300d\u3092\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u3002\u3053\u306e\u4e8c\u6bb5\u968e\u3067\u306f\u3001\u691c\u5b9a\u306e\u6a2a\u8ef8\u3068\u306a\u308b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u304c\u3001\u691c\u5b9a\u5bfe\u8c61\u3067\u3042\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u3068\u72ec\u7acb\u306b\u4e0e\u3048\u3089\u308c\u305f\u3082\u306e\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\u5358\u7d14\u5316\u3059\u308b\u3068\u3001\u307e\u305a\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u898b\u3066\u300c\u3053\u306e\u9806\u5e8f\u304c\u3082\u3063\u3068\u3082\u3089\u3057\u3044\u300d\u3068\u6642\u9593\u8ef8\u3092\u4f5c\u308a\u3001\u305d\u306e\u540c\u3058\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u4f7f\u3063\u3066\u300c\u3053\u306e\u6642\u9593\u8ef8\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u5909\u5316\u3057\u3066\u3044\u308b\u304b\u300d\u3092\u8abf\u3079\u3066\u3044\u308b\u3002\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u306e\u6bb5\u968e\u3067\u3059\u3067\u306b\u767a\u73fe\u69cb\u9020\u3092\u5229\u7528\u3057\u3066\u3044\u308b\u305f\u3081\u3001\u305d\u306e\u69cb\u9020\u3092\u56fa\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u5916\u90e8\u60c5\u5831\u3068\u3057\u3066\u5f8c\u6bb5\u306e\u691c\u5b9a\u3078\u6e21\u3059\u3068\u3001\u901a\u5e38\u306e\u691c\u5b9a\u304c\u60f3\u5b9a\u3059\u308b\u72ec\u7acb\u6027\u304c\u5d29\u308c\u308b\u5834\u5408\u304c\u3042\u308b\u3002\u305d\u306e\u7d50\u679c\u3001\u5e30\u7121\u4eee\u8aac\u304c\u6b63\u3057\u3044\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u3082 P \u5024\u304c\u5fc5\u8981\u4ee5\u4e0a\u306b\u5c0f\u3055\u304f\u306a\u308a\u3001\u7b2c 1 \u7a2e\u904e\u8aa4\u3001\u3059\u306a\u308f\u3061\u672c\u5f53\u306f\u95a2\u9023\u304c\u306a\u3044\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u6709\u610f\u3068\u5224\u5b9a\u3059\u308b\u78ba\u7387\u3092\u5341\u5206\u306b\u5236\u5fa1\u3067\u304d\u306a\u3044\u53ef\u80fd\u6027\u304c\u751f\u3058\u308b\u3002<\/p>\n

Neufeld \u3089\u306f\u3001\u3053\u306e\u554f\u984c\u3092\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u306b\u304a\u3051\u308b\u6f5c\u5728\u5909\u6570\u63a8\u5b9a\u5f8c\u306e\u63a8\u8ad6\u3068\u3057\u3066\u5b9a\u5f0f\u5316\u3057\u3066\u3044\u308b[13]<\/a>\u3002\u7d30\u80de\u306e\u6f5c\u5728\u72b6\u614b\u3001\u4f4e\u6b21\u5143\u8868\u73fe\u3001\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30fc\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u3088\u3046\u306a\u5909\u6570\u3092\u767a\u73fe\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u63a8\u5b9a\u3057\u305f\u5f8c\u3001\u305d\u306e\u63a8\u5b9a\u7d50\u679c\u3068\u540c\u3058\u767a\u73fe\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u95a2\u9023\u3092\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u3068\u3001\u63a8\u5b9a\u5de5\u7a0b\u3092\u7121\u8996\u3057\u305f\u901a\u5e38\u306e P \u5024\u3067\u306f\u8aa4\u5dee\u5236\u5fa1\u304c\u5d29\u308c\u5f97\u308b\u3002Neufeld \u3089\u306f Poisson \u30e2\u30c7\u30eb\u306e\u4e0b\u3067\u30ab\u30a6\u30f3\u30c8\u3092\u5206\u5272\u3057\u3001\u4e00\u65b9\u3092\u6f5c\u5728\u5909\u6570\u306e\u63a8\u5b9a\u3001\u3082\u3046\u4e00\u65b9\u3092\u63a8\u8ad6\u306b\u4f7f\u3046\u30ab\u30a6\u30f3\u30c8\u5206\u5272\uff08count splitting\uff09\u3092\u63d0\u6848\u3057\u3066\u3044\u308b[13]<\/a>\u3002<\/p>\n

scLS \u539f\u8ad6\u6587\u3082\u3001\u3053\u306e\u8ad6\u70b9\u3092\u672a\u89e3\u6c7a\u306e\u7d71\u8a08\u7684\u8ab2\u984c\u3068\u3057\u3066\u8a8d\u3081\u3066\u3044\u308b\u3002scLS \u306f\u8ecc\u8de1\u63a8\u5b9a\u306e\u65b9\u6cd5\u305d\u306e\u3082\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u3059\u3067\u306b\u5f97\u3089\u308c\u305f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u3066\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3092\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u4e0b\u6d41\u624b\u6cd5\u3067\u3042\u308b\u3002\u3057\u304b\u3057\u5b9f\u969b\u306e\u5229\u7528\u3067\u306f\u3001\u540c\u3058\u5358\u4e00\u7d30\u80de\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089 Monocle3 \u3084 Slingshot \u306a\u3069\u3067\u8ecc\u8de1\u3092\u63a8\u5b9a\u3057\u3001\u305d\u306e\u7d50\u679c\u3092 scLS \u3078\u5165\u529b\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u591a\u3044\u3002\u305d\u306e\u305f\u3081\u3001scLS \u306e\u691c\u5b9a\u5f0f\u3060\u3051\u3092\u898b\u3066 P \u5024\u306e\u59a5\u5f53\u6027\u3092\u5224\u65ad\u3059\u308b\u306e\u3067\u306f\u4e0d\u5341\u5206\u3067\u3042\u308a\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u304c\u3069\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u3001\u3069\u306e\u624b\u9806\u3067\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u304b\u307e\u3067\u542b\u3081\u3066\u63a8\u8ad6\u7cfb\u5168\u4f53\u3092\u898b\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n\n
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7.4 \u767a\u73fe\u304c\u5909\u308f\u3063\u305f\u3053\u3068\u3068\u3001\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u3092\u8d77\u3053\u3057\u305f\u3053\u3068\u306f\u5225\u3067\u3042\u308b<\/h3>\n

\u7b2c\u56db\u306e\u5236\u7d04\u306f\u7d71\u8a08\u624b\u6cd5\u56fa\u6709\u3068\u3044\u3046\u3088\u308a\u3001scLS \u306e\u7d50\u679c\u3092\u751f\u7269\u5b66\u7684\u306b\u89e3\u91c8\u3059\u308b\u3068\u304d\u306e\u5c04\u7a0b\u306b\u95a2\u308f\u308b\u3002dynamic expression test \u304c\u6709\u610f\u306a\u3089\u3001\u305d\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u767a\u73fe\u306b\u306f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u69cb\u9020\u7684\u306a\u5909\u5316\u304c\u3042\u308b\u3002shifted expression test \u304c\u6709\u610f\u306a\u3089\u3001\u4e8c\u6761\u4ef6\u306e\u9593\u3067\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u767a\u73fe\u52d5\u614b\u304c\u7570\u306a\u308b\u3002\u3069\u3061\u3089\u3082\u300c\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u306b\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u69cb\u9020\u304c\u3042\u308b\u300d\u3053\u3068\u3092\u691c\u51fa\u3057\u3066\u3044\u308b\u306e\u3067\u3042\u3063\u3066\u3001\u305d\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u304c\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u3092\u958b\u59cb\u3055\u305b\u305f\u539f\u56e0\u3067\u3042\u308b\u3053\u3068\u3092\u76f4\u63a5\u691c\u5b9a\u3057\u3066\u3044\u308b\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\u305f\u3068\u3048\u3070\u3001\u3042\u308b\u8ee2\u5199\u56e0\u5b50 X \u304c\u7d30\u80de\u5206\u5316\u3092\u958b\u59cb\u3057\u3001\u305d\u306e\u4e0b\u6d41\u3067\u907a\u4f1d\u5b50 Y \u306e\u767a\u73fe\u304c\u4e2d\u76e4\u3060\u3051\u4e0a\u6607\u3057\u305f\u3068\u3059\u308b\u3002scLS \u306f Y \u306e\u300c\u4f4e\u3044 \u2192 \u9ad8\u3044 \u2192 \u4f4e\u3044\u300d\u3068\u3044\u3046\u4e00\u904e\u6027\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u3092\u5f37\u304f\u691c\u51fa\u3067\u304d\u308b\u53ef\u80fd\u6027\u304c\u3042\u308b\u3002\u3057\u304b\u3057\u3001\u3053\u306e\u7d50\u679c\u3060\u3051\u3067\u306f Y \u304c\u5206\u5316\u3092\u99c6\u52d5\u3057\u305f\u306e\u304b\u3001X \u306b\u3088\u3063\u3066\u5f15\u304d\u8d77\u3053\u3055\u308c\u305f\u5fdc\u7b54\u306a\u306e\u304b\u3092\u533a\u5225\u3067\u304d\u306a\u3044\u3002\u3055\u3089\u306b\u3001\u7d30\u80de\u72b6\u614b\u305d\u306e\u3082\u306e\u304c\u5909\u5316\u3057\u305f\u7d50\u679c\u3068\u3057\u3066 Y \u306e\u767a\u73fe\u304c\u4e0a\u304c\u3063\u305f\u3060\u3051\u3068\u3044\u3046\u53ef\u80fd\u6027\u3082\u6b8b\u308b\u3002\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3068\u306e\u95a2\u9023\u306f\u3001\u56e0\u679c\u306e\u5411\u304d\u3092\u6c7a\u3081\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

ZC3H20 \u306e\u4f8b\u3067\u6761\u4ef6\u5dee\u3092\u6bd4\u8f03\u3067\u304d\u305f\u306e\u306f\u3001ZC3H20 \u3092\u5b9f\u969b\u306b\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3059\u308b\u3068\u3044\u3046\u4ecb\u5165\u304c\u5143\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u542b\u307e\u308c\u3066\u3044\u305f\u304b\u3089\u3067\u3042\u308b\u3002\u305d\u306e\u4ecb\u5165\u304b\u3089 ZC3H20 \u6761\u4ef6\u3068\u91ce\u751f\u578b\u306e\u9055\u3044\u3092\u8abf\u3079\u308b\u3053\u3068\u306f\u3067\u304d\u308b\u304c\u3001scLS \u304c\u540c\u3058\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u65b0\u305f\u306b\u62fe\u3063\u305f\u3059\u3079\u3066\u306e\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u540c\u3058\u56e0\u679c\u95a2\u4fc2\u304c\u8a3c\u660e\u3055\u308c\u305f\u3053\u3068\u306b\u306f\u306a\u3089\u306a\u3044\u3002\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u304c\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u3092\u99c6\u52d5\u3059\u308b\u304b\u3092\u78ba\u304b\u3081\u308b\u306b\u306f\u3001\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3084\u30ce\u30c3\u30af\u30c0\u30a6\u30f3\u3001\u904e\u5270\u767a\u73fe\u3001\u6642\u7cfb\u5217\u4ecb\u5165\u3001\u6a5f\u80fd\u8a55\u4fa1\u306a\u3069\u3001\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u306e\u89b3\u5bdf\u3068\u306f\u5225\u306e\u8a3c\u62e0\u304c\u5fc5\u8981\u306b\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u3053\u307e\u3067\u306e\u5236\u7d04\u3092\u5408\u308f\u305b\u308b\u3068\u3001scLS \u306e\u5f79\u5272\u3092\u300c\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306e\u9375\u3068\u306a\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u81ea\u52d5\u7684\u306b\u78ba\u5b9a\u3059\u308b\u65b9\u6cd5\u300d\u3068\u8868\u73fe\u3059\u308b\u306e\u306f\u5f37\u3059\u304e\u308b\u3002\u3088\u308a\u6b63\u78ba\u306a\u306e\u306f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306b\u6cbf\u3063\u305f\u4e00\u904e\u6027\u30fb\u975e\u5358\u8abf\u306a\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3084\u3001\u6761\u4ef6\u306b\u3088\u3063\u3066\u5909\u5316\u306e\u4ed5\u65b9\u304c\u7570\u306a\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u304b\u3089\u52b9\u7387\u3088\u304f\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u9806\u4f4d\u4ed8\u3051\u3059\u308b\u65b9\u6cd5<\/strong>\u3068\u4f4d\u7f6e\u4ed8\u3051\u308b\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b\u3002\u5019\u88dc\u62bd\u51fa\u306e\u5f8c\u306b\u306f\u3001\u3069\u306e\u7cfb\u8b5c\u3067\u5dee\u304c\u751f\u3058\u305f\u304b\u3001\u8907\u6570\u306e\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3067\u3082\u518d\u73fe\u3059\u308b\u304b\u3001\u63a8\u5b9a\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u4e0d\u78ba\u5b9f\u6027\u3092\u8003\u616e\u3057\u3066\u3082\u6709\u610f\u304b\u3001\u907a\u4f1d\u5b50\u64cd\u4f5c\u306b\u3088\u3063\u3066\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u304c\u5909\u308f\u308b\u304b\u3068\u3044\u3046\u5225\u306e\u691c\u8a3c\u304c\u7d9a\u304f\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u4f4d\u7f6e\u4ed8\u3051\u306b\u3059\u308b\u3068\u3001scLS \u306e\u5f37\u307f\u3068\u9650\u754c\u306f\u77db\u76fe\u3057\u306a\u3044\u3002\u5468\u6ce2\u6570\u9818\u57df\u3078\u8868\u73fe\u3092\u5909\u3048\u308b\u3053\u3068\u3067\u3001\u7d42\u70b9\u5dee\u3060\u3051\u3067\u306f\u5f31\u304f\u898b\u3048\u308b\u4e00\u904e\u6027\u767a\u73fe\u3092\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u6d6e\u304b\u3073\u4e0a\u304c\u3089\u305b\u3089\u308c\u308b\u3002\u4e00\u65b9\u3001\u305d\u306e\u5019\u88dc\u304c\u3069\u306e\u679d\u3067\u50cd\u304f\u304b\u3001\u751f\u7269\u5b66\u7684\u53cd\u5fa9\u3092\u8d8a\u3048\u3066\u518d\u73fe\u3059\u308b\u304b\u3001\u72b6\u614b\u9077\u79fb\u306e\u539f\u56e0\u304b\u3069\u3046\u304b\u306f\u5225\u306e\u554f\u3044\u3068\u3057\u3066\u6b8b\u308b\u3002scLS \u304c\u5e83\u3052\u305f\u306e\u306f\u300c\u4f55\u3092\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u898b\u3064\u3051\u3089\u308c\u308b\u304b\u300d\u306e\u7bc4\u56f2\u3067\u3042\u308a\u3001\u300c\u898b\u3064\u304b\u3063\u305f\u5019\u88dc\u306b\u3064\u3044\u3066\u4f55\u307e\u3067\u78ba\u5b9a\u3067\u304d\u308b\u304b\u300d\u306e\u7bc4\u56f2\u307e\u3067\u540c\u6642\u306b\u5e83\u3052\u305f\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002<\/p>\n

\n

8. \u72b6\u614b\u3060\u3051\u3092\u898b\u308b\u304b\u3001\u904e\u7a0b\u5168\u4f53\u3092\u898b\u308b\u304b\u3067\u3001\u898b\u3048\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u306f\u5909\u308f\u308b<\/h2>\n

\u3053\u3053\u307e\u3067\u306e Drosophila \u3068 Trypanosoma brucei<\/em> \u306e\u4f8b\u3092\u3064\u306a\u3050\u3068\u3001scLS \u304c\u5909\u3048\u305f\u306e\u306f\u7d30\u80de\u306e\u6e2c\u5b9a\u65b9\u6cd5\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u5165\u529b\u3055\u308c\u308b\u306e\u306f\u3001\u3059\u3067\u306b\u5358\u4e00\u7d30\u80de RNA-seq \u3067\u5f97\u3089\u308c\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u767a\u73fe\u30c7\u30fc\u30bf\u3068\u3001\u305d\u3053\u304b\u3089\u63a8\u5b9a\u3055\u308c\u305f\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u3067\u3042\u308b\u3002\u5909\u66f4\u3055\u308c\u305f\u306e\u306f\u3001\u305d\u306e\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3092\u4f55\u3068\u3057\u3066\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u304b\u3067\u3042\u308b\u3002\u767a\u73fe\u66f2\u7dda\u3092\u6642\u9593\u9818\u57df\u306e\u307e\u307e\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u3067\u6bd4\u8f03\u3059\u308b\u65b9\u6cd5\u3082\u3042\u308c\u3070\u3001\u66f2\u7dda\u5168\u4f53\u3092\u56de\u5e30\u30e2\u30c7\u30eb\u3067\u8868\u3059\u65b9\u6cd5\u3082\u3042\u308b\u3002scLS \u306f\u305d\u3053\u3078\u3001Lomb\u2013Scargle periodogram \u306b\u3088\u3063\u3066\u5468\u6ce2\u6570\u9818\u57df\u3078\u5199\u3057\u3001\u5909\u52d5\u69cb\u9020\u3068\u3057\u3066\u691c\u5b9a\u3059\u308b\u9078\u629e\u80a2\u3092\u52a0\u3048\u305f[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

Drosophila \u306e\u89e3\u6790\u3067\u306f\u3001\u3053\u306e\u9055\u3044\u304c\u5b9f\u969b\u306b\u691c\u51fa\u3055\u308c\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u9055\u3044\u3068\u3057\u3066\u73fe\u308c\u305f\u3002FBgn0040827\u3001FBgn0031277\u3001FBgn0030158\u3001FBgn0262009 \u306e\u3088\u3046\u306b\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u306e\u5f8c\u534a\u3067\u767a\u73fe\u304c\u4e0a\u6607\u3057\u3001\u305d\u306e\u307e\u307e\u9ad8\u3044\u72b6\u614b\u3067\u7d42\u308f\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3067\u306f\u3001\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u5dee\u304c\u5927\u304d\u304f\u6b8b\u308b\u305f\u3081 tradeSeq \u306e startVsEndTest \u304c\u5f37\u304f\u53cd\u5fdc\u3057\u3084\u3059\u3044\u3002\u4e00\u65b9\u3001FBgn0034659\u3001FBgn0035569\u3001FBgn0051406\u3001FBgn0034739\u3001FBgn0036488\u3001FBgn0264344\u3001FBgn0038978\u3001FBgn0035585 \u306e\u3088\u3046\u306b\u4e2d\u76e4\u3067\u30d4\u30fc\u30af\u3092\u4f5c\u3063\u305f\u5f8c\u306b\u4f4e\u4e0b\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3067\u306f\u3001\u59cb\u70b9\u3068\u7d42\u70b9\u306e\u5dee\u304c\u5c0f\u3055\u304f\u3066\u3082 scLS \u304c\u5f37\u304f\u691c\u51fa\u3059\u308b\u4f8b\u304c\u793a\u3055\u308c\u305f[6]<\/a>\u3002\u540c\u3058\u7d30\u80de\u7fa4\u3092\u6e2c\u3063\u3066\u3044\u3066\u3082\u3001\u9014\u4e2d\u306e\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3092\u7d71\u8a08\u91cf\u3078\u6b8b\u3059\u304b\u3069\u3046\u304b\u3067\u3001\u5019\u88dc\u907a\u4f1d\u5b50\u306e\u9806\u4f4d\u304c\u5909\u308f\u308b\u3002<\/p>\n

T. brucei<\/em> \u306e ZC3H20 \u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3067\u3082\u3001\u540c\u3058\u69cb\u9020\u304c\u5225\u306e\u5f62\u3067\u73fe\u308c\u305f\u3002ZC3H20 \u306f\u5b9f\u9a13\u7684\u306b\u30ce\u30c3\u30af\u30a2\u30a6\u30c8\u3055\u308c\u305f\u907a\u4f1d\u5b50\u306a\u306e\u3067\u3001\u91ce\u751f\u578b\u3068\u306e\u6761\u4ef6\u5dee\u304c\u5b58\u5728\u3059\u308b\u3053\u3068\u81ea\u4f53\u306f\u65e2\u77e5\u3067\u3042\u308b\u3002\u305d\u308c\u3067\u3082\u3001\u8ecc\u8de1\u5168\u4f53\u3092\u6bd4\u8f03\u3059\u308b scLS \u3084 patternTest\u3001\u5206\u5c90\u521d\u671f\u306e\u5dee\u3092\u898b\u308b earlyDETest \u3067\u306f\u975e\u5e38\u306b\u5c0f\u3055\u3044 P \u5024\u3092\u793a\u3059\u4e00\u65b9\u3001\u7d42\u70b9\u4ed8\u8fd1\u306e\u5dee\u3092\u898b\u308b diffEndTest \u3067\u306f\u6709\u610f\u6027\u304c\u76f8\u5bfe\u7684\u306b\u5f31\u304b\u3063\u305f[6]<\/a>\u3002\u907a\u4f1d\u5b50\u3082\u30c7\u30fc\u30bf\u3082\u540c\u3058\u307e\u307e\u3067\u3001\u691c\u5b9a\u304c\u898b\u308b\u533a\u9593\u3068\u767a\u73fe\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u306e\u7279\u5fb4\u3092\u5909\u3048\u308b\u3060\u3051\u3067\u3001\u7d71\u8a08\u7684\u306a\u5f37\u3055\u304c\u5909\u308f\u308b\u3002<\/p>\n

\u3053\u306e\u9055\u3044\u3092\u300cscLS \u306f\u9014\u4e2d\u307e\u3067\u898b\u3066\u3044\u308b\u304b\u3089\u6b63\u3057\u304f\u3001\u7d42\u70b9\u3092\u6bd4\u3079\u308b\u65b9\u6cd5\u306f\u60c5\u5831\u3092\u6368\u3066\u3066\u3044\u308b\u300d\u3068\u5358\u7d14\u5316\u3059\u308b\u3068\u3001\u691c\u5b9a\u306e\u5f79\u5272\u3092\u53d6\u308a\u9055\u3048\u308b\u3002\u7d42\u672b\u72b6\u614b\u3067\u767a\u73fe\u91cf\u304c\u7570\u306a\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u77e5\u308a\u305f\u3044\u306a\u3089\u3001\u59cb\u70b9\u3084\u7d42\u70b9\u306b\u7126\u70b9\u3092\u5f53\u3066\u305f\u691c\u5b9a\u306f\u76ee\u7684\u306b\u5408\u3063\u3066\u3044\u308b\u3002\u5206\u5316\u306e\u9014\u4e2d\u3060\u3051\u4e00\u6642\u7684\u306b\u767a\u73fe\u3059\u308b\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u63a2\u3057\u305f\u3044\u306a\u3089\u3001\u9014\u4e2d\u306e\u5f62\u3092\u4fdd\u6301\u3059\u308b\u691c\u5b9a\u304c\u5fc5\u8981\u306b\u306a\u308b\u3002\u539f\u8ad6\u6587\u304c\u5f37\u8abf\u3057\u3066\u3044\u308b\u306e\u3082\u3001\u3059\u3079\u3066\u306e\u554f\u3044\u3092\u4e00\u3064\u306e\u691c\u5b9a\u3078\u7d71\u5408\u3059\u308b\u3053\u3068\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u3069\u306e\u7a2e\u985e\u306e\u907a\u4f1d\u5b50\u3092\u62bd\u51fa\u3057\u305f\u3044\u304b\u3092\u5148\u306b\u5b9a\u3081\u3001\u305d\u308c\u306b\u9069\u3057\u305f\u65b9\u6cd5\u3092\u9078\u3076\u3053\u3068\u3067\u3042\u308b[6]<\/a>\u3002<\/p>\n

\u3053\u3053\u3067\u7b2c 2 \u7ae0\u306e tradeSeq \u306b\u623b\u308b\u3068\u3001associationTest\u3001startVsEndTest\u3001patternTest\u3001diffEndTest \u304c\u5225\u3005\u306b\u5b58\u5728\u3059\u308b\u7406\u7531\u3082\u540c\u3058\u3068\u3053\u308d\u306b\u3042\u308b\u3002\u305d\u308c\u305e\u308c\u306f\u4e00\u3064\u306e\u300c\u771f\u306e\u767a\u73fe\u5dee\u300d\u3092\u7570\u306a\u308b\u7cbe\u5ea6\u3067\u63a8\u5b9a\u3057\u3066\u3044\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u64ec\u4f3c\u6642\u9593\u4e0a\u306e\u7570\u306a\u308b\u7279\u5fb4\u306b\u3064\u3044\u3066\u5225\u306e\u5e30\u7121\u4eee\u8aac\u3092\u691c\u5b9a\u3057\u3066\u3044\u308b\u3002scLS \u3082\u305d\u306e\u7cfb\u5217\u306b\u4e00\u3064\u306e\u8868\u73fe\u3068\u691c\u5b9a\u3092\u8ffd\u52a0\u3057\u305f\u306e\u3067\u3042\u308a\u3001\u5f93\u6765\u306e\u554f\u3044\u3092\u7121\u52b9\u306b\u3057\u305f\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u3044\u3002\u89e3\u6790\u6cd5\u306e\u9078\u629e\u306f\u3001\u8a08\u7b97\u30a2\u30eb\u30b4\u30ea\u30ba\u30e0\u306e\u9078\u629e\u3067\u3042\u308b\u3068\u540c\u6642\u306b\u3001\u3069\u306e\u767a\u73fe\u5909\u5316\u3092\u5019\u88dc\u3068\u3057\u3066\u524d\u666f\u5316\u3059\u308b\u304b\u3092\u6c7a\u3081\u308b\u5de5\u7a0b\u306b\u306a\u308b\u3002<\/p>\n

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